More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8624 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  42.98 
 
 		 1488 aa  705    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  39.33 
 
 		 1197 aa  706    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  55.52 
 
 		 1528 aa  1457    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  42.17 
 
 		 1509 aa  719    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  58.33 
 
 		 1495 aa  1565    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  100 
 
 		 1528 aa  3086    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  41.4 
 
 		 1259 aa  736    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  49.81 
 
 		 1489 aa  1316    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  38.45 
 
 		 1485 aa  701    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  59 
 
 		 1518 aa  1566    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  57.01 
 
 		 1508 aa  1548    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  36.43 
 
 		 2144 aa  516  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.32 
 
 		 1527 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1189 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  28.75 
 
 		 1673 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1541 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1541 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1541 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1699 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1541 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1541 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1381 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1541 aa  373  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  30.61 
 
 		 1495 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  28.76 
 
 		 1639 aa  369  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1487 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  29.17 
 
 		 1679 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  30.99 
 
 		 1494 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  30.99 
 
 		 1494 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.73 
 
 		 1614 aa  366  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  30 
 
 		 1517 aa  356  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5394  hypothetical protein  62.46 
 
 		 467 aa  354  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  29.44 
 
 		 1595 aa  353  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  29.37 
 
 		 1586 aa  347  8e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1611 aa  340  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  27.92 
 
 		 1576 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.24 
 
 		 1572 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1505 aa  315  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.89 
 
 		 1568 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.2 
 
 		 1446 aa  312  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  28.25 
 
 		 1457 aa  311  6.999999999999999e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1531 aa  311  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1600 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1554 aa  307  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  28.08 
 
 		 1423 aa  303  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  27.72 
 
 		 1475 aa  301  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  27.7 
 
 		 1437 aa  300  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  28.03 
 
 		 1616 aa  299  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  28.01 
 
 		 1421 aa  298  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1492 aa  297  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1466 aa  294  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.14 
 
 		 1348 aa  293  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1553 aa  289  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  29.69 
 
 		 1434 aa  286  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  26.15 
 
 		 1428 aa  283  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1552 aa  280  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.85 
 
 		 1543 aa  278  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  27.02 
 
 		 1386 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1547 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  27.68 
 
 		 1385 aa  276  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  26.22 
 
 		 1447 aa  276  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  27.03 
 
 		 1560 aa  274  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  27.72 
 
 		 1400 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  29.44 
 
 		 924 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1586 aa  273  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1520 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.52 
 
 		 1362 aa  270  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  25.94 
 
 		 1422 aa  270  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  26.98 
 
 		 1609 aa  266  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1411 aa  266  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1551 aa  265  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  28.12 
 
 		 931 aa  265  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1409 aa  263  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1527 aa  261  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1602 aa  260  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.98 
 
 		 1550 aa  258  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  25.86 
 
 		 1593 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  27.09 
 
 		 1359 aa  254  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.27 
 
 		 1626 aa  253  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  27.39 
 
 		 1379 aa  251  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  27.04 
 
 		 1530 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  25.24 
 
 		 1573 aa  250  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1419 aa  246  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  26.87 
 
 		 1539 aa  243  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1565 aa  239  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1565 aa  239  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1410 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  28.37 
 
 		 866 aa  238  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  24.29 
 
 		 1368 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1229 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.14 
 
 		 2096 aa  234  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  26.5 
 
 		 1539 aa  230  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.73 
 
 		 1428 aa  230  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  26.9 
 
 		 1579 aa  231  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1494 aa  229  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  26.32 
 
 		 1150 aa  227  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  23.91 
 
 		 1401 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1620 aa  226  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  26.11 
 
 		 1150 aa  225  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.86 
 
 		 1981 aa  226  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>