More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0330 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  38.37 
 
 
1400 aa  806    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  39.2 
 
 
1359 aa  800    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  38.55 
 
 
1385 aa  815    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  100 
 
 
1402 aa  2901    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  36.55 
 
 
1229 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  38.88 
 
 
1409 aa  813    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  40.62 
 
 
1410 aa  862    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  93.62 
 
 
1390 aa  2626    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  98.76 
 
 
1418 aa  2643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  37.98 
 
 
1411 aa  788    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  38.12 
 
 
1386 aa  786    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  38.63 
 
 
1379 aa  864    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  40.15 
 
 
1419 aa  858    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  33.02 
 
 
1446 aa  599  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  34.79 
 
 
1140 aa  589  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  31.96 
 
 
1421 aa  557  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  32.25 
 
 
1568 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  41.11 
 
 
867 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  31.16 
 
 
1531 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  40.21 
 
 
866 aa  499  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  32.46 
 
 
1149 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  33.06 
 
 
1362 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  31.61 
 
 
1149 aa  489  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  30.87 
 
 
1150 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  30.84 
 
 
1150 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  30.66 
 
 
1150 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.75 
 
 
1150 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  32.5 
 
 
1348 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  30.05 
 
 
1530 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  34.56 
 
 
855 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  30.04 
 
 
1604 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  30.51 
 
 
1583 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  35.09 
 
 
924 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  30.67 
 
 
1586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  30.41 
 
 
1547 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  30.39 
 
 
1527 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  29.82 
 
 
1560 aa  400  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  30.05 
 
 
1520 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  29.58 
 
 
1550 aa  396  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  30.54 
 
 
1551 aa  393  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  28.21 
 
 
1654 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  29.52 
 
 
1554 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.02 
 
 
1626 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.92 
 
 
1620 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  30.21 
 
 
1981 aa  373  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.97 
 
 
1429 aa  364  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  29.15 
 
 
1573 aa  361  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  29.11 
 
 
1611 aa  353  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  40.86 
 
 
561 aa  350  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  29.13 
 
 
1572 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.6 
 
 
1576 aa  337  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  29.42 
 
 
1602 aa  335  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  38.11 
 
 
555 aa  334  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.06 
 
 
1609 aa  323  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.57 
 
 
1595 aa  320  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  47.4 
 
 
480 aa  318  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  29.01 
 
 
1586 aa  318  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  27.43 
 
 
1494 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  27.43 
 
 
1494 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  28.04 
 
 
1319 aa  308  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  27.89 
 
 
1495 aa  300  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.25 
 
 
1487 aa  300  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  26.45 
 
 
1541 aa  295  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  25.9 
 
 
1517 aa  294  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  26.45 
 
 
1541 aa  292  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  26.1 
 
 
1541 aa  292  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 
1541 aa  291  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 
1541 aa  291  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 
1541 aa  291  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 
1381 aa  290  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  47.85 
 
 
451 aa  283  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.84 
 
 
1518 aa  278  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.74 
 
 
1485 aa  276  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  25.41 
 
 
1475 aa  275  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 
1553 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  27.67 
 
 
1673 aa  270  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  27 
 
 
1317 aa  270  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  27.08 
 
 
1679 aa  267  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.18 
 
 
1508 aa  267  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  25.06 
 
 
1423 aa  266  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 
1197 aa  265  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  24.34 
 
 
1437 aa  259  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  24.93 
 
 
1457 aa  259  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.53 
 
 
1434 aa  258  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.92 
 
 
1384 aa  257  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.69 
 
 
1528 aa  256  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  31.81 
 
 
1614 aa  252  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  28.6 
 
 
1365 aa  252  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  23.98 
 
 
1428 aa  248  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  25.3 
 
 
1495 aa  244  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.65 
 
 
1509 aa  244  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  26.61 
 
 
1639 aa  243  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  24.39 
 
 
1447 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.77 
 
 
1527 aa  239  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  24.23 
 
 
1422 aa  238  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 
1699 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  24.75 
 
 
1494 aa  235  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.15 
 
 
1488 aa  231  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 
1600 aa  227  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2612  YD repeat-containing protein  32.4 
 
 
497 aa  225  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.346414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>