More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6958 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  42.95 
 
 		 1259 aa  785    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  55.95 
 
 		 1508 aa  1479    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  100 
 
 		 1495 aa  3023    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  41.63 
 
 		 1488 aa  683    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  41.22 
 
 		 1485 aa  741    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  58.07 
 
 		 1528 aa  1563    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  57.67 
 
 		 1528 aa  1562    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  52.33 
 
 		 1489 aa  1332    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  57.68 
 
 		 1518 aa  1531    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  43.52 
 
 		 1509 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  42.3 
 
 		 1197 aa  754    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  38.44 
 
 		 2144 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1699 aa  422  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.24 
 
 		 1527 aa  415  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  30.7 
 
 		 1189 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  31.6 
 
 		 1639 aa  403  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  32.06 
 
 		 1517 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  30.92 
 
 		 1495 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  31.29 
 
 		 1541 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  30.96 
 
 		 1541 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  30.96 
 
 		 1541 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  30.96 
 
 		 1541 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  30.96 
 
 		 1381 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1487 aa  386  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1541 aa  383  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1541 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  31.62 
 
 		 1673 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  31.02 
 
 		 1494 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  31.02 
 
 		 1494 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  31.22 
 
 		 1679 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  29.78 
 
 		 1553 aa  365  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.8 
 
 		 1576 aa  354  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  29.37 
 
 		 1572 aa  350  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.47 
 
 		 1614 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5394  hypothetical protein  61.61 
 
 		 467 aa  345  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1611 aa  342  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.25 
 
 		 1595 aa  338  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.35 
 
 		 1586 aa  333  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  30.58 
 
 		 1505 aa  333  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  29.84 
 
 		 1475 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  28.43 
 
 		 1437 aa  324  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  29.2 
 
 		 1457 aa  323  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1600 aa  323  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  29.67 
 
 		 1423 aa  322  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1547 aa  321  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1586 aa  317  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  27.05 
 
 		 1422 aa  314  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  27.4 
 
 		 1543 aa  312  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  29.28 
 
 		 1616 aa  311  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1552 aa  311  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1520 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1527 aa  309  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.27 
 
 		 1429 aa  307  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1551 aa  307  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  28.36 
 
 		 1434 aa  306  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.44 
 
 		 1554 aa  306  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.85 
 
 		 1981 aa  305  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1368 aa  304  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  27.79 
 
 		 1447 aa  299  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.29 
 
 		 1550 aa  298  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.43 
 
 		 1609 aa  295  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.21 
 
 		 1560 aa  294  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.34 
 
 		 1348 aa  293  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  27.05 
 
 		 1428 aa  290  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1531 aa  289  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  27.93 
 
 		 1421 aa  288  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.31 
 
 		 1492 aa  287  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  30.89 
 
 		 931 aa  287  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  26.34 
 
 		 1539 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  27.31 
 
 		 1539 aa  284  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1411 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.02 
 
 		 1446 aa  282  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1409 aa  281  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.83 
 
 		 1573 aa  281  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1466 aa  281  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1400 aa  280  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.41 
 
 		 1362 aa  277  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  28.63 
 
 		 1428 aa  276  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  28.66 
 
 		 1579 aa  275  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.92 
 
 		 1385 aa  274  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  28.82 
 
 		 1602 aa  274  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.98 
 
 		 1386 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.6 
 
 		 1568 aa  267  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  27.09 
 
 		 1359 aa  267  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  27.45 
 
 		 1626 aa  265  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  27.75 
 
 		 1379 aa  264  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  28.19 
 
 		 924 aa  263  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  27.88 
 
 		 1593 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  26.06 
 
 		 1401 aa  259  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1410 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.88 
 
 		 1390 aa  254  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1402 aa  254  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1418 aa  251  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1352 aa  250  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1419 aa  248  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.34 
 
 		 1384 aa  248  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.86 
 
 		 2035 aa  244  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.14 
 
 		 2096 aa  240  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.55 
 
 		 3027 aa  239  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  27.53 
 
 		 867 aa  239  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>