More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2818 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  60.76 
 
 		 1639 aa  1983    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  97.51 
 
 		 1673 aa  3121    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  42.41 
 
 		 1699 aa  953    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  100 
 
 		 1679 aa  3461    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  32.23 
 
 		 1527 aa  516  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  32.38 
 
 		 1189 aa  509  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  33.21 
 
 		 1485 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  30.62 
 
 		 1197 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  30.94 
 
 		 1259 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  32.86 
 
 		 1541 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  31.23 
 
 		 1494 aa  427  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  31.23 
 
 		 1494 aa  427  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  32.68 
 
 		 1541 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  32.68 
 
 		 1381 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  32.68 
 
 		 1541 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  32.68 
 
 		 1541 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  32.68 
 
 		 1541 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  32.68 
 
 		 1541 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  33.3 
 
 		 1488 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  29.11 
 
 		 1509 aa  409  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1553 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  31 
 
 		 1495 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  31.62 
 
 		 1487 aa  396  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  30.59 
 
 		 1517 aa  394  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  30.97 
 
 		 1518 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  31.71 
 
 		 1475 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  30.46 
 
 		 1528 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  30.68 
 
 		 1423 aa  377  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  31.2 
 
 		 1495 aa  370  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  29.17 
 
 		 1528 aa  367  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  30.88 
 
 		 1457 aa  363  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  28.73 
 
 		 1422 aa  358  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  28.51 
 
 		 1447 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  28.68 
 
 		 1428 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  28.53 
 
 		 1437 aa  353  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  29.05 
 
 		 1508 aa  353  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  28.52 
 
 		 1489 aa  350  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  29.79 
 
 		 1576 aa  345  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1600 aa  345  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1505 aa  344  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  29.62 
 
 		 1616 aa  335  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  31.64 
 
 		 931 aa  333  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  29 
 
 		 1572 aa  321  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1611 aa  320  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  29.27 
 
 		 1595 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  29.07 
 
 		 1586 aa  308  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  27.69 
 
 		 1434 aa  307  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.22 
 
 		 1614 aa  303  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1409 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1547 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.99 
 
 		 1554 aa  286  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.92 
 
 		 1348 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1520 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1550 aa  283  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  28.72 
 
 		 2144 aa  282  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.4 
 
 		 1609 aa  281  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1586 aa  281  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1552 aa  280  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1400 aa  281  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  27.39 
 
 		 1543 aa  278  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  27.03 
 
 		 1385 aa  276  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1368 aa  275  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.93 
 
 		 1560 aa  273  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1418 aa  271  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1620 aa  270  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  27.69 
 
 		 1531 aa  270  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1551 aa  268  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1527 aa  267  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1402 aa  266  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1602 aa  266  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  25.38 
 
 		 1573 aa  264  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1390 aa  264  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1411 aa  263  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.82 
 
 		 1568 aa  258  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1492 aa  258  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1466 aa  257  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.83 
 
 		 1579 aa  254  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.62 
 
 		 1428 aa  248  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.5 
 
 		 1362 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1386 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  28.16 
 
 		 1530 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  26.87 
 
 		 1446 aa  240  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  25.88 
 
 		 1401 aa  238  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  23.74 
 
 		 1626 aa  237  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  25.49 
 
 		 1593 aa  234  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  27.51 
 
 		 924 aa  233  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  27.51 
 
 		 1379 aa  232  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  25.8 
 
 		 1410 aa  231  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  25.38 
 
 		 1539 aa  231  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  26.73 
 
 		 1421 aa  230  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  25.4 
 
 		 1539 aa  231  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1352 aa  221  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  25.8 
 
 		 1565 aa  220  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  25.8 
 
 		 1565 aa  220  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 2035 aa  216  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1419 aa  215  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1319 aa  214  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  26.81 
 
 		 1359 aa  214  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1600 aa  212  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.4 
 
 		 2096 aa  213  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>