More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0353 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  33.84 
 
 		 1620 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  80.88 
 
 		 1527 aa  2401    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  42.43 
 
 		 1609 aa  1098    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  43.36 
 
 		 1573 aa  1098    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  56.77 
 
 		 1560 aa  1594    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1547 aa  3184    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  91.87 
 
 		 1550 aa  2686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  32.11 
 
 		 1626 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  85.18 
 
 		 583 aa  849    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  75.19 
 
 		 934 aa  1413    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  89.56 
 
 		 1520 aa  2693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  79.28 
 
 		 1551 aa  2392    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  88.5 
 
 		 598 aa  907    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  35 
 
 		 1586 aa  601  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  32.85 
 
 		 1554 aa  572  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  33.15 
 
 		 1602 aa  562  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  94.51 
 
 		 414 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  34.53 
 
 		 1362 aa  522  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  33.59 
 
 		 1981 aa  493  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  32.99 
 
 		 1429 aa  493  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  33.1 
 
 		 1446 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  33.87 
 
 		 1421 aa  479  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  30.8 
 
 		 1411 aa  466  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  31.06 
 
 		 1409 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  32.51 
 
 		 1568 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  30.94 
 
 		 1400 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  30.38 
 
 		 1386 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  30.26 
 
 		 1385 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  30.92 
 
 		 1348 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  30.64 
 
 		 1611 aa  445  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  31.11 
 
 		 1595 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  30.62 
 
 		 1586 aa  436  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  30.27 
 
 		 1576 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  30.5 
 
 		 1572 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  29.34 
 
 		 1654 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  30.74 
 
 		 1531 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  30.59 
 
 		 1614 aa  420  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  34.22 
 
 		 924 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1604 aa  415  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  33.11 
 
 		 867 aa  413  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  30.46 
 
 		 1418 aa  413  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  30.13 
 
 		 1410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1402 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  30.26 
 
 		 1390 aa  407  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  34.78 
 
 		 866 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1583 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  29.07 
 
 		 1530 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  29.39 
 
 		 1419 aa  389  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  29.77 
 
 		 1434 aa  390  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  29.95 
 
 		 1379 aa  387  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  29.59 
 
 		 1485 aa  383  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  32.01 
 
 		 1319 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1229 aa  373  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1197 aa  372  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  28.7 
 
 		 1518 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  28.39 
 
 		 1259 aa  369  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  29.09 
 
 		 1359 aa  366  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  28.56 
 
 		 1508 aa  356  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1317 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  30.57 
 
 		 1428 aa  354  5.9999999999999994e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  28.12 
 
 		 1593 aa  353  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  30.65 
 
 		 1579 aa  353  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  26.84 
 
 		 1384 aa  349  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1466 aa  344  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.02 
 
 		 1492 aa  344  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  27.33 
 
 		 1543 aa  343  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  29.69 
 
 		 1509 aa  344  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1552 aa  343  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  28.69 
 
 		 1401 aa  339  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  29.99 
 
 		 1410 aa  337  9e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  30.1 
 
 		 1488 aa  332  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  27.96 
 
 		 1528 aa  331  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  29.63 
 
 		 1400 aa  328  7e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1699 aa  327  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  28.72 
 
 		 1405 aa  324  7e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  27.11 
 
 		 1388 aa  322  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  29.41 
 
 		 1426 aa  321  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1426 aa  321  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  27.29 
 
 		 1368 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  29.3 
 
 		 1426 aa  320  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  29.79 
 
 		 1429 aa  320  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  29.58 
 
 		 1200 aa  319  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1216 aa  319  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1251 aa  319  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  29.33 
 
 		 1397 aa  317  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  29.42 
 
 		 1398 aa  316  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  28.73 
 
 		 1397 aa  313  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.69 
 
 		 1495 aa  313  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  26.55 
 
 		 1539 aa  313  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  28.28 
 
 		 1411 aa  313  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1397 aa  312  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  29.12 
 
 		 1397 aa  311  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1411 aa  311  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  28.64 
 
 		 1411 aa  311  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  28.54 
 
 		 1411 aa  311  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1411 aa  311  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  29.38 
 
 		 1377 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  26.8 
 
 		 1417 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  26.85 
 
 		 1399 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  29.08 
 
 		 1199 aa  309  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>