More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0536 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  96.85 
 
 		 1426 aa  2809    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  90.26 
 
 		 1200 aa  2033    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  74.23 
 
 		 1411 aa  2173    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  76.94 
 
 		 1377 aa  1984    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  74.09 
 
 		 1411 aa  2167    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  83.61 
 
 		 682 aa  1035    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  76.47 
 
 		 1397 aa  1975    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  76.25 
 
 		 1388 aa  1972    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  96.78 
 
 		 1426 aa  2809    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  75.88 
 
 		 1399 aa  1972    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  75.38 
 
 		 1417 aa  1927    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  76.25 
 
 		 1409 aa  1975    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  75.6 
 
 		 1308 aa  1974    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  76.94 
 
 		 1397 aa  1989    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  75.67 
 
 		 1410 aa  1946    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  76.86 
 
 		 1397 aa  1987    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  91.6 
 
 		 1400 aa  2399    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  96.85 
 
 		 1426 aa  2809    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  73.53 
 
 		 1411 aa  2157    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  76.86 
 
 		 586 aa  789    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  81.89 
 
 		 1199 aa  1770    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  95.24 
 
 		 1268 aa  2428    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  69.39 
 
 		 1388 aa  1778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  74.7 
 
 		 713 aa  751    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  77.55 
 
 		 1415 aa  2095    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  73.95 
 
 		 1411 aa  2170    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  76.31 
 
 		 1397 aa  1972    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  74.16 
 
 		 1411 aa  2173    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  69.48 
 
 		 1365 aa  1961    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  69.09 
 
 		 1405 aa  1759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  76.39 
 
 		 1377 aa  1976    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  93.97 
 
 		 1398 aa  2417    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  92.22 
 
 		 1405 aa  2417    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  82.9 
 
 		 1251 aa  2137    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  90.48 
 
 		 1216 aa  2068    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  70.53 
 
 		 1394 aa  2011    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  100 
 
 		 1429 aa  2924    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  38.29 
 
 		 1490 aa  742    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  74.23 
 
 		 1411 aa  2173    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  33.2 
 
 		 1525 aa  623  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  34.24 
 
 		 1509 aa  625  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  76.56 
 
 		 554 aa  619  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  34.03 
 
 		 1528 aa  614  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  77.08 
 
 		 502 aa  561  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  77.31 
 
 		 477 aa  548  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  76.79 
 
 		 477 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  77.31 
 
 		 477 aa  549  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  76.72 
 
 		 477 aa  545  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  76.72 
 
 		 477 aa  545  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  76.72 
 
 		 477 aa  545  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  29.47 
 
 		 1677 aa  445  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  32.55 
 
 		 1319 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1317 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1770 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  35.5 
 
 		 1679 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  32.85 
 
 		 1791 aa  357  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.23 
 
 		 1547 aa  321  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1586 aa  314  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  29.33 
 
 		 1560 aa  301  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1520 aa  298  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.75 
 
 		 1626 aa  296  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  28.15 
 
 		 1620 aa  294  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  27.58 
 
 		 1527 aa  292  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1554 aa  292  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.5 
 
 		 1551 aa  290  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.38 
 
 		 1550 aa  290  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.31 
 
 		 1609 aa  280  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  29.34 
 
 		 1981 aa  278  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.39 
 
 		 1429 aa  265  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  77.12 
 
 		 314 aa  263  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  77.12 
 
 		 314 aa  263  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  76.47 
 
 		 314 aa  261  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1583 aa  261  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  76.47 
 
 		 233 aa  261  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  77.48 
 
 		 312 aa  259  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.44 
 
 		 1528 aa  258  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  28.88 
 
 		 1379 aa  254  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1604 aa  247  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.61 
 
 		 1348 aa  239  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  27.15 
 
 		 1434 aa  233  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1602 aa  229  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  25.07 
 
 		 1421 aa  225  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  29.93 
 
 		 1385 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  28.71 
 
 		 1419 aa  223  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  25.3 
 
 		 1446 aa  222  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1229 aa  221  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.65 
 
 		 1362 aa  220  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  30.31 
 
 		 1400 aa  219  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1492 aa  218  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  27.36 
 
 		 1543 aa  215  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1552 aa  214  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1466 aa  210  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  31.46 
 
 		 1568 aa  208  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  27.9 
 
 		 1573 aa  207  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  28.97 
 
 		 1411 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  93.27 
 
 		 290 aa  201  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  93.27 
 
 		 290 aa  201  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.52 
 
 		 1517 aa  197  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.26 
 
 		 2096 aa  197  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1409 aa  195  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>