More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1115 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  69.47 
 
 		 1426 aa  1778    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  69.75 
 
 		 1251 aa  1780    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  68.04 
 
 		 1200 aa  1459    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  67.74 
 
 		 1411 aa  1743    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  68.36 
 
 		 1377 aa  1746    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  68.14 
 
 		 1411 aa  1747    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  68.07 
 
 		 682 aa  754    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  68.28 
 
 		 1397 aa  1745    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  67.96 
 
 		 1377 aa  1738    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  69.39 
 
 		 1426 aa  1774    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  68.95 
 
 		 1405 aa  1770    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  68.12 
 
 		 1397 aa  1737    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  69.47 
 
 		 1426 aa  1778    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  68.04 
 
 		 1409 aa  1746    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  70.16 
 
 		 1417 aa  1794    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  70.2 
 
 		 1415 aa  1821    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  67.74 
 
 		 1411 aa  1743    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  67.58 
 
 		 1411 aa  1739    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  68.33 
 
 		 1216 aa  1490    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  67.8 
 
 		 1388 aa  1739    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  68.06 
 
 		 1411 aa  1749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  70.4 
 
 		 1410 aa  1811    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  68.95 
 
 		 1398 aa  1766    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  66.13 
 
 		 1394 aa  1744    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  67.71 
 
 		 1399 aa  1741    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  69.39 
 
 		 1429 aa  1778    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  64.38 
 
 		 1365 aa  1674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  100 
 
 		 1388 aa  2853    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  77.43 
 
 		 1405 aa  2103    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  67.43 
 
 		 1411 aa  1739    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  67.88 
 
 		 1397 aa  1735    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  69.3 
 
 		 1268 aa  1770    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  67.88 
 
 		 1397 aa  1736    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  67.83 
 
 		 1308 aa  1735    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  68.15 
 
 		 713 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  68.77 
 
 		 1400 aa  1759    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  65.12 
 
 		 1199 aa  1472    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  37.15 
 
 		 1490 aa  745    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  58.01 
 
 		 586 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  33.45 
 
 		 1525 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  33.26 
 
 		 1509 aa  589  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  32.01 
 
 		 1528 aa  578  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  70.19 
 
 		 554 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  69.38 
 
 		 502 aa  503  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  67.54 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  67.54 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  67.54 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  67.54 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  67.54 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  67.25 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1317 aa  420  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1679 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1319 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1770 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  28.66 
 
 		 1791 aa  363  9e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  35.38 
 
 		 1677 aa  349  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1583 aa  326  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1547 aa  315  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27 
 
 		 1602 aa  310  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  29.13 
 
 		 1573 aa  301  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.34 
 
 		 1609 aa  296  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1550 aa  295  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1604 aa  288  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  28.15 
 
 		 1620 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.51 
 
 		 1626 aa  285  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1520 aa  283  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.14 
 
 		 1560 aa  280  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1586 aa  280  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1551 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1527 aa  274  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  26.03 
 
 		 1446 aa  274  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.87 
 
 		 1362 aa  271  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  28.05 
 
 		 1229 aa  263  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  25.34 
 
 		 1421 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1400 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  27.43 
 
 		 1385 aa  255  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1411 aa  251  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1654 aa  250  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  74.67 
 
 		 314 aa  245  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  74.67 
 
 		 314 aa  245  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1409 aa  244  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  74 
 
 		 314 aa  244  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.27 
 
 		 1528 aa  244  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  74 
 
 		 233 aa  243  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  74 
 
 		 312 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  27.76 
 
 		 866 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 		 1554 aa  231  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1386 aa  228  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  28.44 
 
 		 1568 aa  224  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  27.69 
 
 		 1981 aa  224  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  29.16 
 
 		 1419 aa  223  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.06 
 
 		 1348 aa  221  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  24.82 
 
 		 1530 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.29 
 
 		 1429 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  27.99 
 
 		 1379 aa  214  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  24.67 
 
 		 1434 aa  210  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1466 aa  209  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1418 aa  204  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.68 
 
 		 1518 aa  204  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1410 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>