More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0499 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  90.22 
 
 		 597 aa  869    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1604 aa  3264    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  36.85 
 
 		 1654 aa  774    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  85.25 
 
 		 1583 aa  2603    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  36.96 
 
 		 1446 aa  621  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  34.29 
 
 		 1385 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  34.93 
 
 		 1411 aa  589  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  34.42 
 
 		 1400 aa  582  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  33.41 
 
 		 1229 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  36.23 
 
 		 1421 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  32.5 
 
 		 1409 aa  543  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  33.36 
 
 		 1386 aa  539  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  34 
 
 		 1410 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  33.25 
 
 		 1531 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  31.51 
 
 		 1140 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1586 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  30.3 
 
 		 1418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1402 aa  439  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1390 aa  440  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  33.77 
 
 		 1554 aa  426  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  31.95 
 
 		 1379 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  31.06 
 
 		 1530 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1520 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  30.26 
 
 		 1550 aa  417  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1547 aa  416  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  31.04 
 
 		 1568 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  30.29 
 
 		 1527 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1551 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  29.73 
 
 		 1359 aa  403  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  29.62 
 
 		 1560 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  31.63 
 
 		 1348 aa  396  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  32.09 
 
 		 1362 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.97 
 
 		 1626 aa  389  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1419 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  32.23 
 
 		 855 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  32.97 
 
 		 1602 aa  364  9e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  28.61 
 
 		 1620 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  28.5 
 
 		 1509 aa  351  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  29.06 
 
 		 1525 aa  346  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  35.16 
 
 		 866 aa  344  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  28.9 
 
 		 1528 aa  343  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1317 aa  333  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.64 
 
 		 1609 aa  329  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1319 aa  326  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  33.07 
 
 		 924 aa  321  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1411 aa  320  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  26.03 
 
 		 1411 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  32.22 
 
 		 867 aa  315  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  26.43 
 
 		 1411 aa  313  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  27.53 
 
 		 1415 aa  313  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1377 aa  312  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  26.03 
 
 		 1411 aa  312  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  25.9 
 
 		 1411 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  26.24 
 
 		 1399 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1411 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  26.1 
 
 		 1397 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  27.63 
 
 		 1410 aa  310  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  25.94 
 
 		 1377 aa  309  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  26.78 
 
 		 1397 aa  309  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  26.1 
 
 		 1308 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  27.42 
 
 		 1268 aa  308  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3343  RHS protein  71.77 
 
 		 384 aa  308  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  26.1 
 
 		 1397 aa  306  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  25.96 
 
 		 1388 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  26.57 
 
 		 1394 aa  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  26.5 
 
 		 1409 aa  304  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  26.94 
 
 		 1426 aa  302  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1426 aa  302  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  27.2 
 
 		 1400 aa  302  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  26.87 
 
 		 1426 aa  300  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  25.96 
 
 		 1397 aa  301  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  27.31 
 
 		 1417 aa  300  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  26.99 
 
 		 1398 aa  296  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  26.59 
 
 		 1251 aa  295  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.8 
 
 		 1573 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  27.84 
 
 		 1981 aa  290  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  26.53 
 
 		 1388 aa  288  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.32 
 
 		 1429 aa  287  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  25.61 
 
 		 1365 aa  285  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.5 
 
 		 1428 aa  282  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  33.97 
 
 		 555 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1490 aa  264  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  27.77 
 
 		 1200 aa  263  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1216 aa  263  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.37 
 
 		 1614 aa  258  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  27.36 
 
 		 1405 aa  256  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1611 aa  255  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.35 
 
 		 1434 aa  254  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  25.54 
 
 		 1593 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1405 aa  251  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1199 aa  249  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  26.87 
 
 		 1429 aa  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.84 
 
 		 1595 aa  242  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.19 
 
 		 1576 aa  241  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1149 aa  240  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.12 
 
 		 1586 aa  239  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  33.39 
 
 		 553 aa  238  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  32.39 
 
 		 598 aa  238  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.87 
 
 		 1579 aa  237  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.54 
 
 		 1572 aa  234  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>