More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1171 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  99.74 
 
 		 1552 aa  3152    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  59.96 
 
 		 1539 aa  1669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  41.41 
 
 		 1579 aa  763    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  63.25 
 
 		 1593 aa  1845    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  100 
 
 		 1543 aa  3160    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  60.04 
 
 		 1539 aa  1679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  43.19 
 
 		 1466 aa  1086    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  38.55 
 
 		 1434 aa  806    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  40.92 
 
 		 1428 aa  762    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  42.67 
 
 		 1492 aa  1085    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  47.28 
 
 		 613 aa  479  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1792  YD repeat-containing protein  66.28 
 
 		 348 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1609  YD repeat-containing protein  66.28 
 
 		 348 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0462  YD repeat-containing protein  66.28 
 
 		 352 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0412  YD repeat-containing protein  66.77 
 
 		 342 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0858889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1586 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  36.31 
 
 		 693 aa  359  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  28.6 
 
 		 1197 aa  357  6.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1368 aa  356  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.8 
 
 		 1485 aa  356  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  29.24 
 
 		 1518 aa  355  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  30.37 
 
 		 1259 aa  355  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1547 aa  353  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  26.08 
 
 		 1401 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  27.91 
 
 		 1560 aa  351  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  27.91 
 
 		 1527 aa  347  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 1550 aa  345  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  29.26 
 
 		 1528 aa  342  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  29 
 
 		 1508 aa  343  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 1551 aa  342  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.1 
 
 		 1568 aa  340  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  26.41 
 
 		 1609 aa  336  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 1520 aa  335  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1554 aa  334  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1611 aa  330  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  28.92 
 
 		 1572 aa  326  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.8 
 
 		 1446 aa  321  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.95 
 
 		 1576 aa  320  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  27.71 
 
 		 1421 aa  318  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  28.09 
 
 		 1495 aa  318  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.77 
 
 		 1362 aa  316  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  29.21 
 
 		 1509 aa  315  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  30.29 
 
 		 1488 aa  313  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.79 
 
 		 1614 aa  311  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  28.5 
 
 		 1620 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1531 aa  304  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  29.81 
 
 		 924 aa  303  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.19 
 
 		 1348 aa  301  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.44 
 
 		 1586 aa  298  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  29.28 
 
 		 1595 aa  298  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.44 
 
 		 1573 aa  297  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.41 
 
 		 1626 aa  292  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.95 
 
 		 1489 aa  291  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  26.94 
 
 		 1528 aa  286  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1604 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1400 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  28.13 
 
 		 1673 aa  281  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1602 aa  281  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1410 aa  281  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1191  YD repeat-containing protein  63.16 
 
 		 425 aa  279  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  27.43 
 
 		 1679 aa  278  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2826  substrate-binding repeat-containing protein  64.36 
 
 		 419 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.64 
 
 		 1385 aa  275  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1409 aa  272  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  28.96 
 
 		 2144 aa  270  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.47 
 
 		 1981 aa  266  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1699 aa  265  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1386 aa  262  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  25.84 
 
 		 1411 aa  258  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1419 aa  256  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1189 aa  256  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  26.42 
 
 		 1639 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1527 aa  254  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1352 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1494 aa  240  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1487 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.36 
 
 		 1517 aa  233  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1541 aa  233  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1583 aa  233  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.36 
 
 		 2096 aa  233  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1319 aa  232  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1553 aa  232  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  25.28 
 
 		 1447 aa  231  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1565 aa  231  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1565 aa  231  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  25.53 
 
 		 1359 aa  230  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1600 aa  230  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.71 
 
 		 1429 aa  230  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1541 aa  229  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1541 aa  229  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1541 aa  229  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1541 aa  228  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  27.8 
 
 		 2277 aa  228  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.24 
 
 		 1494 aa  228  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1494 aa  228  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1381 aa  227  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  27.06 
 
 		 1308 aa  227  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  27.34 
 
 		 1495 aa  227  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1418 aa  227  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1251 aa  227  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>