More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0794 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  76.22 
 
 		 1426 aa  1970    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  78.8 
 
 		 1199 aa  1706    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  96.45 
 
 		 554 aa  736    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  98.11 
 
 		 477 aa  978    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  75.48 
 
 		 1200 aa  1613    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  93.79 
 
 		 1411 aa  2466    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  97.59 
 
 		 1377 aa  2488    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  94.8 
 
 		 1411 aa  2483    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  77.5 
 
 		 682 aa  855    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  98.32 
 
 		 477 aa  979    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  96.96 
 
 		 1397 aa  2476    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  80.34 
 
 		 1251 aa  2077    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  76.38 
 
 		 1426 aa  1974    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  97.43 
 
 		 1308 aa  2486    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  97.48 
 
 		 477 aa  969    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  100 
 
 		 1399 aa  2872    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  70.46 
 
 		 1415 aa  1823    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  97.9 
 
 		 477 aa  975    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  66.59 
 
 		 1405 aa  1693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  97.27 
 
 		 1377 aa  2481    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  99.28 
 
 		 1409 aa  2533    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  76.3 
 
 		 1405 aa  1979    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  75.88 
 
 		 1429 aa  1972    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  70.43 
 
 		 1410 aa  1812    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  68.16 
 
 		 1417 aa  1790    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  67.71 
 
 		 1388 aa  1741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  77.42 
 
 		 586 aa  695    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  94.57 
 
 		 1411 aa  2483    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  96.96 
 
 		 1388 aa  2479    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  76.31 
 
 		 1398 aa  1963    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  99.2 
 
 		 1394 aa  2533    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  97.04 
 
 		 1397 aa  2483    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  93.79 
 
 		 1411 aa  2466    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  98.11 
 
 		 477 aa  978    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  94.39 
 
 		 1365 aa  2397    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  76.22 
 
 		 1426 aa  1970    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1525 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  76.45 
 
 		 1268 aa  1965    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  98.11 
 
 		 477 aa  978    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  76.21 
 
 		 1400 aa  1962    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  98.2 
 
 		 713 aa  1006    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  94.33 
 
 		 1411 aa  2475    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  96.64 
 
 		 1397 aa  2474    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  94.18 
 
 		 1411 aa  2470    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  75.66 
 
 		 1216 aa  1641    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  96.56 
 
 		 1397 aa  2466    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  36.99 
 
 		 1490 aa  752    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  33.99 
 
 		 1509 aa  635  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  33.75 
 
 		 1528 aa  622  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  72.6 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  33.38 
 
 		 1317 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  32.83 
 
 		 1319 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  34.5 
 
 		 1679 aa  355  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  32.83 
 
 		 1791 aa  346  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  33.45 
 
 		 1677 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  33.37 
 
 		 1770 aa  342  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1583 aa  321  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1547 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1604 aa  310  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1602 aa  300  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.94 
 
 		 1626 aa  299  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  90.2 
 
 		 314 aa  299  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  90.2 
 
 		 314 aa  299  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  89.54 
 
 		 314 aa  297  7e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  29.87 
 
 		 1620 aa  297  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  89.54 
 
 		 233 aa  296  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  31.11 
 
 		 1981 aa  294  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  90.07 
 
 		 312 aa  293  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.35 
 
 		 1609 aa  291  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1586 aa  290  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  29 
 
 		 1573 aa  288  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  30.68 
 
 		 1429 aa  281  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.02 
 
 		 1434 aa  239  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1554 aa  238  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1520 aa  235  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1492 aa  232  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1400 aa  231  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.97 
 
 		 1348 aa  227  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.15 
 
 		 1385 aa  226  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.43 
 
 		 1528 aa  226  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.7 
 
 		 1362 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.59 
 
 		 1527 aa  221  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1551 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.67 
 
 		 1543 aa  218  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1552 aa  217  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1229 aa  217  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  24.71 
 
 		 1654 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1550 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  99.04 
 
 		 290 aa  213  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  99.04 
 
 		 290 aa  213  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  26.5 
 
 		 1530 aa  212  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  29.15 
 
 		 1410 aa  207  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  28.08 
 
 		 1379 aa  204  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  27.22 
 
 		 1560 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  27.59 
 
 		 1259 aa  201  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  27.26 
 
 		 1409 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  26.66 
 
 		 866 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  25.98 
 
 		 1593 aa  197  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.37 
 
 		 1494 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 		 1494 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>