More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1826 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  100 
 
 		 1429 aa  2937    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  89.82 
 
 		 1981 aa  2405    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1586 aa  525  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  33.57 
 
 		 1560 aa  502  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  33.17 
 
 		 1554 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  33.42 
 
 		 1520 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  33.05 
 
 		 1527 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1547 aa  493  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  33.11 
 
 		 1550 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  32.91 
 
 		 1551 aa  493  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  34.48 
 
 		 1602 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  32.4 
 
 		 1573 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  32.18 
 
 		 1626 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  31.12 
 
 		 1446 aa  423  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  32.86 
 
 		 1609 aa  413  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  31.47 
 
 		 1362 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  30.25 
 
 		 1411 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  29.88 
 
 		 1421 aa  392  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  30.69 
 
 		 1531 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1611 aa  389  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  31.05 
 
 		 1348 aa  384  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1409 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  30.03 
 
 		 1386 aa  380  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  30.16 
 
 		 1576 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  30.74 
 
 		 1568 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1390 aa  367  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  28.43 
 
 		 1400 aa  366  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  30.64 
 
 		 1410 aa  365  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1418 aa  365  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  29.97 
 
 		 1402 aa  364  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1319 aa  362  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  29.08 
 
 		 1385 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  30.07 
 
 		 1614 aa  357  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1620 aa  356  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  30.78 
 
 		 1317 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  29.51 
 
 		 1259 aa  352  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1419 aa  347  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  28.79 
 
 		 1530 aa  346  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  29.39 
 
 		 1379 aa  343  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.95 
 
 		 1485 aa  343  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  28.66 
 
 		 1572 aa  342  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  30.96 
 
 		 1586 aa  334  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  29.43 
 
 		 1359 aa  334  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1229 aa  333  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1197 aa  333  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  30.63 
 
 		 1595 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  29.07 
 
 		 1509 aa  332  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  35.57 
 
 		 934 aa  319  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  29.21 
 
 		 1518 aa  315  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  31.84 
 
 		 924 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  31 
 
 		 867 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.19 
 
 		 1495 aa  303  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  30.81 
 
 		 1365 aa  295  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  30.94 
 
 		 1377 aa  295  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  30.79 
 
 		 1397 aa  294  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1377 aa  290  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  29.96 
 
 		 866 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  30.63 
 
 		 1388 aa  289  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  30.56 
 
 		 1411 aa  289  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1604 aa  288  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  30.38 
 
 		 1397 aa  287  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  30.36 
 
 		 1411 aa  286  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1492 aa  286  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1411 aa  286  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  30.58 
 
 		 1411 aa  286  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1654 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1583 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  30.45 
 
 		 1308 aa  285  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  30.45 
 
 		 1411 aa  284  9e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  30.31 
 
 		 1411 aa  284  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  30.35 
 
 		 1397 aa  282  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1466 aa  281  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  30.68 
 
 		 1399 aa  281  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  30.13 
 
 		 1394 aa  280  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  30.47 
 
 		 1409 aa  279  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  29.88 
 
 		 1397 aa  276  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1565 aa  275  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1565 aa  275  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.04 
 
 		 1434 aa  273  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  28.14 
 
 		 1528 aa  272  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.77 
 
 		 1527 aa  272  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  29.23 
 
 		 1140 aa  271  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  27.13 
 
 		 1368 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  29.7 
 
 		 1400 aa  270  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1541 aa  268  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1541 aa  268  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1381 aa  268  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1541 aa  268  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1541 aa  267  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1541 aa  267  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1541 aa  267  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  29.39 
 
 		 1429 aa  265  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  27.41 
 
 		 1517 aa  266  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.94 
 
 		 1488 aa  266  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.93 
 
 		 1508 aa  264  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1352 aa  264  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  29.73 
 
 		 1398 aa  263  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  28.96 
 
 		 1415 aa  260  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  29.73 
 
 		 1189 aa  260  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  26.23 
 
 		 1593 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>