More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4081 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  67.12 
 
 		 1385 aa  1558    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  67.39 
 
 		 1400 aa  1565    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  70.37 
 
 		 1411 aa  1641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  68.72 
 
 		 855 aa  1186    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  100 
 
 		 1140 aa  2362    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  72.1 
 
 		 1229 aa  1662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  75.02 
 
 		 1409 aa  1735    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  92.78 
 
 		 867 aa  1091    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  89.03 
 
 		 555 aa  869    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  40.89 
 
 		 1410 aa  753    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  69.56 
 
 		 1386 aa  1600    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  72.08 
 
 		 866 aa  867    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2612  YD repeat-containing protein  71.93 
 
 		 497 aa  701    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  36.51 
 
 		 1359 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  34.79 
 
 		 1418 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  34.79 
 
 		 1390 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  34.7 
 
 		 1402 aa  589  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  35.37 
 
 		 1446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  34.87 
 
 		 1421 aa  558  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  33.84 
 
 		 1419 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  34.23 
 
 		 1379 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  31.7 
 
 		 1604 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  32.3 
 
 		 1531 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1583 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1654 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  31.72 
 
 		 1530 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  31.51 
 
 		 1568 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  68.62 
 
 		 561 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2528  YD repeat-containing protein  67.82 
 
 		 283 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  30.56 
 
 		 1348 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  94.79 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  32.57 
 
 		 1362 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1586 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  28.91 
 
 		 1602 aa  337  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  27.82 
 
 		 1150 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  27.82 
 
 		 1150 aa  336  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1150 aa  334  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1149 aa  334  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1149 aa  333  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1554 aa  332  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  27.26 
 
 		 1150 aa  327  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  34.68 
 
 		 924 aa  313  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  29.23 
 
 		 1520 aa  298  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1527 aa  295  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1547 aa  295  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1550 aa  294  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1551 aa  291  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  30.52 
 
 		 1981 aa  287  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.6 
 
 		 1609 aa  284  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.77 
 
 		 1626 aa  273  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.18 
 
 		 1429 aa  271  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  93.94 
 
 		 451 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  27.84 
 
 		 1573 aa  262  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  30.02 
 
 		 1620 aa  255  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  27.23 
 
 		 1560 aa  252  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.51 
 
 		 1614 aa  243  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  26.22 
 
 		 1437 aa  238  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1600 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.95 
 
 		 1494 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1494 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1495 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  24.46 
 
 		 1505 aa  229  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1487 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.45 
 
 		 1572 aa  222  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1319 aa  222  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1317 aa  222  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  24.86 
 
 		 1422 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.96 
 
 		 1576 aa  218  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.07 
 
 		 1595 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.74 
 
 		 1586 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1611 aa  214  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  26.68 
 
 		 1565 aa  214  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  26.68 
 
 		 1565 aa  214  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.53 
 
 		 1579 aa  212  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  24.25 
 
 		 1616 aa  211  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.53 
 
 		 1428 aa  211  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  25.51 
 
 		 1517 aa  210  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  28.69 
 
 		 934 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  25.18 
 
 		 1457 aa  207  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  25.17 
 
 		 1485 aa  207  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  24.82 
 
 		 1447 aa  207  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  25 
 
 		 1475 aa  204  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.16 
 
 		 1197 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  24.17 
 
 		 1508 aa  202  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  24.84 
 
 		 1428 aa  201  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1541 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.63 
 
 		 1541 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1541 aa  197  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1541 aa  197  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1541 aa  197  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.54 
 
 		 1541 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1381 aa  195  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  28.65 
 
 		 1415 aa  193  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  24.31 
 
 		 1423 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  28.08 
 
 		 1417 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  31.49 
 
 		 597 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.76 
 
 		 1509 aa  191  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  24.64 
 
 		 1489 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1509 aa  189  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1528 aa  188  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>