More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03331 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  74.67 
 
 
1426 aa  2172    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  95.69 
 
 
554 aa  735    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  92.33 
 
 
477 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  75.09 
 
 
1200 aa  1644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  100 
 
 
1411 aa  2907    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  97.2 
 
 
1377 aa  2495    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  98.37 
 
 
1411 aa  2863    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  75.4 
 
 
682 aa  874    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  93.22 
 
 
477 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  95.93 
 
 
1397 aa  2459    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  96.41 
 
 
1397 aa  2481    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  74.81 
 
 
1426 aa  2175    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  96.21 
 
 
713 aa  989    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  68.74 
 
 
1410 aa  1831    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  100 
 
 
1411 aa  2907    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  97.05 
 
 
1397 aa  2494    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  74.67 
 
 
1426 aa  2172    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  67.74 
 
 
1388 aa  1743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  96.15 
 
 
1388 aa  2469    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  69.66 
 
 
1415 aa  1842    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  97.38 
 
 
1411 aa  2838    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  77.46 
 
 
1268 aa  1984    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  70.94 
 
 
586 aa  709    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  96.07 
 
 
1409 aa  2467    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  77.19 
 
 
1398 aa  1986    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  75.27 
 
 
1216 aa  1673    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  92.92 
 
 
477 aa  652    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  76.16 
 
 
1405 aa  2002    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  96.08 
 
 
1377 aa  2470    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  74.23 
 
 
1429 aa  2173    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  92.33 
 
 
477 aa  651    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  69.62 
 
 
1417 aa  1792    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  97.59 
 
 
1411 aa  2845    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  92.63 
 
 
477 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  37 
 
 
1490 aa  754    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  96.39 
 
 
1308 aa  2474    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  87.41 
 
 
1365 aa  2459    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  93.79 
 
 
1399 aa  2466    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  76.15 
 
 
1400 aa  1986    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  88.64 
 
 
1394 aa  2516    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  98.25 
 
 
1397 aa  2524    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  66.61 
 
 
1405 aa  1695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  99.15 
 
 
1411 aa  2887    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  92.33 
 
 
477 aa  651    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  81.12 
 
 
1251 aa  2092    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  79.79 
 
 
1199 aa  1725    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  34.52 
 
 
1525 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  33.89 
 
 
1509 aa  629  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  33.77 
 
 
1528 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  74.36 
 
 
502 aa  544  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  33.11 
 
 
1317 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  32.42 
 
 
1319 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  34.14 
 
 
1679 aa  348  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  32.8 
 
 
1791 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  33.41 
 
 
1677 aa  339  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  33.1 
 
 
1770 aa  334  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 
1583 aa  313  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.58 
 
 
1602 aa  311  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  28.64 
 
 
1547 aa  311  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 
1604 aa  310  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  91.45 
 
 
314 aa  302  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  91.45 
 
 
314 aa  302  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  28.54 
 
 
1520 aa  302  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  29.63 
 
 
1573 aa  301  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.361613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  90.79 
 
 
314 aa  301  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  29.37 
 
 
1620 aa  301  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  30.99 
 
 
1981 aa  301  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  90.79 
 
 
233 aa  300  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.69 
 
 
1626 aa  300  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.89 
 
 
1527 aa  298  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.86 
 
 
1551 aa  297  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  27.49 
 
 
1609 aa  297  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  91.33 
 
 
312 aa  297  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.85 
 
 
1550 aa  293  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  27.9 
 
 
1586 aa  292  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  30.36 
 
 
1429 aa  286  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.32 
 
 
1362 aa  276  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.6 
 
 
1560 aa  274  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.87 
 
 
1528 aa  250  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.27 
 
 
1348 aa  247  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  27.81 
 
 
1554 aa  240  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.95 
 
 
1434 aa  236  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  27.04 
 
 
1400 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.84 
 
 
1385 aa  229  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  27.18 
 
 
1543 aa  228  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.18 
 
 
1552 aa  226  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.38 
 
 
1489 aa  224  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.61 
 
 
1492 aa  222  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 
1411 aa  221  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 
1654 aa  220  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  26.02 
 
 
1530 aa  215  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  28.8 
 
 
1229 aa  214  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  28.87 
 
 
1379 aa  214  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 
1466 aa  213  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  98.08 
 
 
290 aa  212  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  98.08 
 
 
290 aa  212  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  29.03 
 
 
1410 aa  210  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 
1386 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  26.68 
 
 
866 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  28.01 
 
 
1259 aa  202  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>