More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6085 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  37.01 
 
 		 1379 aa  731    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  43.47 
 
 		 1385 aa  1011    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1410 aa  2881    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  41.22 
 
 		 1140 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  41.81 
 
 		 1229 aa  904    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  44.43 
 
 		 1409 aa  1016    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  39.69 
 
 		 1386 aa  866    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  40.3 
 
 		 1402 aa  874    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  34.72 
 
 		 1446 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  39.3 
 
 		 1359 aa  804    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  34.71 
 
 		 1421 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  40.41 
 
 		 1390 aa  873    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  38.82 
 
 		 1419 aa  808    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  42.5 
 
 		 1400 aa  1025    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  39.26 
 
 		 1411 aa  907    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  40.15 
 
 		 1418 aa  867    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  41.39 
 
 		 855 aa  619  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  41.45 
 
 		 867 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  32.03 
 
 		 1530 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  32.03 
 
 		 1604 aa  533  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  40.42 
 
 		 866 aa  526  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  31.16 
 
 		 1654 aa  525  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  32.98 
 
 		 1150 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  30.93 
 
 		 1583 aa  521  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  32.8 
 
 		 1150 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  32.71 
 
 		 1150 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  32.36 
 
 		 1150 aa  516  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  31.93 
 
 		 1531 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  33.52 
 
 		 1149 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  30.59 
 
 		 1568 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  32.76 
 
 		 1149 aa  486  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  33.45 
 
 		 1362 aa  459  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  32.53 
 
 		 1586 aa  456  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  31.42 
 
 		 1348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  34.87 
 
 		 924 aa  429  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1554 aa  428  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  27.91 
 
 		 1422 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1547 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.58 
 
 		 1551 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  30.2 
 
 		 1560 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  28.26 
 
 		 1550 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  28.19 
 
 		 1520 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1527 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.69 
 
 		 1609 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  30.5 
 
 		 1981 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1602 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  30.82 
 
 		 1429 aa  365  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  28.61 
 
 		 1573 aa  362  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.6 
 
 		 1626 aa  358  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1611 aa  357  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  42.47 
 
 		 561 aa  355  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  39.22 
 
 		 555 aa  348  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1620 aa  342  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  29.61 
 
 		 1572 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  29.28 
 
 		 1576 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1319 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  30.26 
 
 		 1614 aa  326  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  28.57 
 
 		 1528 aa  325  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1317 aa  322  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  29.26 
 
 		 1595 aa  321  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  29.16 
 
 		 1586 aa  320  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  28.82 
 
 		 1388 aa  311  6.999999999999999e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  42.79 
 
 		 480 aa  308  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.51 
 
 		 1485 aa  307  8.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  28.72 
 
 		 1308 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  26.68 
 
 		 1487 aa  300  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  28.49 
 
 		 1494 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1494 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  26.93 
 
 		 1475 aa  293  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  26.91 
 
 		 1457 aa  292  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  26.81 
 
 		 1437 aa  292  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  27.87 
 
 		 1517 aa  291  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  28.46 
 
 		 1509 aa  290  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  26.61 
 
 		 1423 aa  290  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  25.48 
 
 		 1447 aa  288  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1197 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1495 aa  285  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2612  YD repeat-containing protein  36.62 
 
 		 497 aa  283  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  28.04 
 
 		 1543 aa  282  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1397 aa  281  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.52 
 
 		 1434 aa  281  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  29.12 
 
 		 1397 aa  281  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1552 aa  280  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1411 aa  280  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  29.18 
 
 		 1411 aa  278  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  28.65 
 
 		 1397 aa  278  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  29.18 
 
 		 1411 aa  278  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  28.81 
 
 		 1411 aa  277  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1411 aa  277  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  28.65 
 
 		 1397 aa  276  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  28.91 
 
 		 1411 aa  276  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1377 aa  276  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  28.78 
 
 		 1394 aa  276  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  29.6 
 
 		 1365 aa  275  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  28 
 
 		 1259 aa  275  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  28.37 
 
 		 1399 aa  275  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  28.83 
 
 		 1409 aa  274  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  28.67 
 
 		 1488 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  28.12 
 
 		 1377 aa  273  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  25.35 
 
 		 1428 aa  271  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>