More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5261 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1487 aa  3028    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  34.97 
 
 		 1541 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  34.97 
 
 		 1541 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  34.97 
 
 		 1541 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  58.16 
 
 		 1517 aa  1682    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  35.04 
 
 		 1541 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  83.07 
 
 		 1495 aa  2281    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  34.97 
 
 		 1541 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  34.64 
 
 		 1541 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  89.17 
 
 		 1494 aa  2435    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  89.17 
 
 		 1494 aa  2435    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  35.77 
 
 		 1381 aa  632  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  33.73 
 
 		 1553 aa  628  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.77 
 
 		 1527 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  34.36 
 
 		 1189 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  31.64 
 
 		 1437 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  32.31 
 
 		 1475 aa  486  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  32.48 
 
 		 1457 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  30.8 
 
 		 1422 aa  479  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  30.89 
 
 		 1447 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  32.17 
 
 		 1423 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  30.6 
 
 		 1428 aa  459  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  33.49 
 
 		 1485 aa  449  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  33.45 
 
 		 1259 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  32.48 
 
 		 1639 aa  426  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1699 aa  422  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  31.03 
 
 		 1673 aa  411  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  31.89 
 
 		 1509 aa  407  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  31.25 
 
 		 1679 aa  405  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  32.77 
 
 		 1488 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  31.13 
 
 		 1518 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  30.52 
 
 		 1528 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1197 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  30.19 
 
 		 1489 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  30.21 
 
 		 1495 aa  380  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1505 aa  372  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  30.85 
 
 		 1528 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  29.41 
 
 		 1616 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1600 aa  363  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  29.74 
 
 		 1411 aa  362  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  34.06 
 
 		 931 aa  354  8e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  30 
 
 		 1508 aa  352  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1409 aa  346  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1400 aa  344  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  29.98 
 
 		 1611 aa  341  5e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  28.02 
 
 		 1385 aa  341  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  26.77 
 
 		 1446 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  29.12 
 
 		 1572 aa  318  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  28.16 
 
 		 1386 aa  317  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  29 
 
 		 1576 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  30.3 
 
 		 1614 aa  315  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  28.32 
 
 		 1421 aa  313  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1418 aa  309  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1390 aa  303  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1229 aa  302  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  30.07 
 
 		 1586 aa  298  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  29.98 
 
 		 1595 aa  298  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  27.58 
 
 		 1402 aa  296  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  28.5 
 
 		 1547 aa  293  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  29.32 
 
 		 1527 aa  292  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.02 
 
 		 1410 aa  291  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1520 aa  290  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.9 
 
 		 1551 aa  288  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  27.8 
 
 		 1359 aa  287  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1550 aa  288  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  27.45 
 
 		 1379 aa  281  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.34 
 
 		 1626 aa  280  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.35 
 
 		 1568 aa  280  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1531 aa  280  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  29.75 
 
 		 2144 aa  278  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  28.15 
 
 		 1401 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.86 
 
 		 1362 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.41 
 
 		 1348 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1419 aa  270  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1586 aa  269  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1620 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  30.82 
 
 		 1609 aa  261  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  27.13 
 
 		 1530 aa  260  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1352 aa  259  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  27.57 
 
 		 1560 aa  258  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1368 aa  257  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  28.29 
 
 		 1434 aa  256  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1554 aa  251  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  30.75 
 
 		 924 aa  251  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  27.11 
 
 		 1981 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.69 
 
 		 1429 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1565 aa  242  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1565 aa  242  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  30.83 
 
 		 867 aa  241  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.79 
 
 		 1600 aa  239  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  26.84 
 
 		 1539 aa  239  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  28.5 
 
 		 1602 aa  235  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  27.89 
 
 		 1150 aa  233  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  27.8 
 
 		 1150 aa  233  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.87 
 
 		 1543 aa  232  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1150 aa  232  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1552 aa  231  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.58 
 
 		 1428 aa  230  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.58 
 
 		 1579 aa  230  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  27.33 
 
 		 1150 aa  229  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>