More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1504 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  96.14 
 
 		 1475 aa  2545    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  100 
 
 		 1457 aa  2991    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  38.21 
 
 		 1600 aa  736    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  78.31 
 
 		 1437 aa  2118    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  89.64 
 
 		 1423 aa  2425    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  94.15 
 
 		 931 aa  1597    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  71.56 
 
 		 1447 aa  1937    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  38 
 
 		 1505 aa  733    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  71.45 
 
 		 1428 aa  1934    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  37.56 
 
 		 1616 aa  719    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  71.1 
 
 		 1422 aa  1926    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  32.32 
 
 		 1494 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  32.32 
 
 		 1494 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  32.22 
 
 		 1487 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  32.29 
 
 		 1495 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  30.2 
 
 		 1517 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  31.61 
 
 		 1348 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.82 
 
 		 1527 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  31.67 
 
 		 1485 aa  415  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  29.6 
 
 		 1197 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1189 aa  383  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1541 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1541 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1541 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  30.04 
 
 		 1541 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  29.85 
 
 		 1541 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  29.52 
 
 		 1381 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1541 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  31.52 
 
 		 1488 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  29.25 
 
 		 1639 aa  364  9e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  29.62 
 
 		 1553 aa  363  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  30.88 
 
 		 1679 aa  361  5e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  30.4 
 
 		 1673 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0145  YD repeat protein  58.55 
 
 		 361 aa  351  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  28.13 
 
 		 1518 aa  343  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  30.44 
 
 		 1509 aa  343  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  28.96 
 
 		 1508 aa  328  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  28.62 
 
 		 1489 aa  328  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.85 
 
 		 1446 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  29.5 
 
 		 1259 aa  327  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  28.36 
 
 		 1528 aa  327  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  27.25 
 
 		 1379 aa  323  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  24.11 
 
 		 1699 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  29.03 
 
 		 1495 aa  320  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1400 aa  316  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  28.25 
 
 		 1528 aa  311  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1386 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  27.66 
 
 		 1421 aa  305  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.1 
 
 		 1409 aa  304  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1411 aa  300  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1527 aa  299  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  27.85 
 
 		 1359 aa  296  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.61 
 
 		 1614 aa  293  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1547 aa  290  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1410 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.11 
 
 		 1385 aa  286  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.92 
 
 		 1550 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.37 
 
 		 1551 aa  280  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 1520 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1419 aa  272  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1418 aa  272  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.96 
 
 		 1576 aa  267  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.83 
 
 		 1568 aa  266  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1390 aa  266  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.05 
 
 		 1572 aa  265  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.81 
 
 		 1560 aa  264  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1402 aa  260  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.14 
 
 		 1595 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.74 
 
 		 1434 aa  256  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.36 
 
 		 1586 aa  254  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1554 aa  253  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  27.34 
 
 		 1609 aa  253  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  27.39 
 
 		 2144 aa  249  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1466 aa  248  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1492 aa  248  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1531 aa  243  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  29.6 
 
 		 924 aa  239  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.09 
 
 		 1362 aa  234  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1611 aa  232  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0368  hypothetical protein  70.14 
 
 		 283 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1368 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.51 
 
 		 1626 aa  226  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0645  Rhs core protein  41.72 
 
 		 444 aa  225  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.746843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  25.61 
 
 		 1573 aa  220  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  24.36 
 
 		 1401 aa  219  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1586 aa  218  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1229 aa  212  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.19 
 
 		 2096 aa  212  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  26.75 
 
 		 1428 aa  209  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  26.35 
 
 		 1579 aa  209  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  25.37 
 
 		 1140 aa  209  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1604 aa  206  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  23.67 
 
 		 1530 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1352 aa  204  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1583 aa  199  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1602 aa  199  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  24.69 
 
 		 1593 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.44 
 
 		 1384 aa  198  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.68 
 
 		 1429 aa  193  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 867 aa  190  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>