More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2694 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  36.74 
 
 		 1505 aa  709    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  36.61 
 
 		 1600 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  71.39 
 
 		 1475 aa  1940    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  68.81 
 
 		 1423 aa  1878    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  93.01 
 
 		 1447 aa  2457    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  73.09 
 
 		 1437 aa  1972    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  73.36 
 
 		 931 aa  1279    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  100 
 
 		 1428 aa  2944    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  36.09 
 
 		 1616 aa  696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  71.45 
 
 		 1457 aa  1952    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  81.06 
 
 		 1422 aa  2201    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  32.86 
 
 		 1494 aa  502  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  32.86 
 
 		 1494 aa  502  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1495 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1487 aa  476  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  30.57 
 
 		 1517 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1527 aa  432  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0145  YD repeat protein  77.07 
 
 		 361 aa  416  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  30.42 
 
 		 1485 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1197 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  31.65 
 
 		 1189 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1553 aa  364  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1541 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1541 aa  360  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1541 aa  360  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1541 aa  360  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  27.92 
 
 		 1541 aa  359  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1381 aa  358  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  28.68 
 
 		 1679 aa  356  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1541 aa  354  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  28.26 
 
 		 1639 aa  352  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  28.4 
 
 		 1673 aa  343  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  28.66 
 
 		 1509 aa  340  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  28.6 
 
 		 1488 aa  328  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  28.25 
 
 		 1508 aa  326  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  28.24 
 
 		 1259 aa  323  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  27.31 
 
 		 1489 aa  318  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  27.77 
 
 		 1518 aa  317  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  27.68 
 
 		 1528 aa  311  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1409 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.79 
 
 		 1379 aa  299  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1411 aa  299  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.63 
 
 		 1385 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1400 aa  293  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1386 aa  292  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  26.45 
 
 		 1446 aa  282  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  25.38 
 
 		 1359 aa  280  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  26.71 
 
 		 1495 aa  280  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  26.17 
 
 		 1528 aa  279  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1419 aa  279  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  25.71 
 
 		 1421 aa  270  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  26.1 
 
 		 1699 aa  270  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.56 
 
 		 1434 aa  269  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1410 aa  269  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.26 
 
 		 1576 aa  266  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.65 
 
 		 1614 aa  265  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1418 aa  257  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1492 aa  253  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1390 aa  251  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1466 aa  251  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1527 aa  250  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 		 1611 aa  251  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.52 
 
 		 1572 aa  250  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1402 aa  249  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.5 
 
 		 1595 aa  249  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.41 
 
 		 1586 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  26.13 
 
 		 2144 aa  245  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.37 
 
 		 1568 aa  243  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  27.84 
 
 		 1609 aa  240  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1551 aa  239  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1550 aa  236  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.16 
 
 		 1362 aa  235  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1547 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0368  hypothetical protein  71.33 
 
 		 283 aa  233  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.54 
 
 		 1560 aa  233  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.02 
 
 		 1520 aa  230  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  29.84 
 
 		 924 aa  230  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1531 aa  225  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1368 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.22 
 
 		 1543 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1552 aa  221  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1554 aa  220  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0645  Rhs core protein  44.12 
 
 		 444 aa  219  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.746843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1229 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.87 
 
 		 2096 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.86 
 
 		 1348 aa  212  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1352 aa  208  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1604 aa  208  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1583 aa  207  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  26.09 
 
 		 1579 aa  204  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  26.4 
 
 		 1428 aa  203  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  23.17 
 
 		 1530 aa  201  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1620 aa  199  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  25.18 
 
 		 1140 aa  197  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  24.66 
 
 		 1401 aa  197  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1586 aa  197  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.14 
 
 		 1384 aa  190  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  27.38 
 
 		 867 aa  189  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.15 
 
 		 1573 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1602 aa  184  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>