More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2508 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  42.54 
 
 		 1673 aa  1339    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1699 aa  3560    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  43.19 
 
 		 1679 aa  1351    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  43.41 
 
 		 1639 aa  1308    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1527 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  30.64 
 
 		 1189 aa  503  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1553 aa  433  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.78 
 
 		 1485 aa  426  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1487 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  29.77 
 
 		 1494 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1494 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.51 
 
 		 1495 aa  419  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1541 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1381 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  28.42 
 
 		 1259 aa  419  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1541 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1541 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1541 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  27.18 
 
 		 1508 aa  416  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1541 aa  416  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1541 aa  416  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1197 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  28.86 
 
 		 1517 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1495 aa  406  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  27.51 
 
 		 1528 aa  399  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  27.09 
 
 		 1509 aa  390  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.06 
 
 		 1518 aa  373  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.66 
 
 		 1488 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.65 
 
 		 1528 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.72 
 
 		 1489 aa  352  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  25.24 
 
 		 1475 aa  352  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  25.02 
 
 		 1423 aa  342  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  24.77 
 
 		 1457 aa  340  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1505 aa  339  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1600 aa  336  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  27.99 
 
 		 1616 aa  337  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1547 aa  330  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1550 aa  328  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1520 aa  328  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  26.02 
 
 		 1428 aa  327  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.57 
 
 		 1434 aa  327  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  25.1 
 
 		 1437 aa  325  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  27.28 
 
 		 1576 aa  318  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1551 aa  318  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.94 
 
 		 1614 aa  316  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.35 
 
 		 1572 aa  315  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1527 aa  313  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  25.73 
 
 		 1573 aa  312  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  22.8 
 
 		 1626 aa  305  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.13 
 
 		 1586 aa  303  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.4 
 
 		 1595 aa  303  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.81 
 
 		 1609 aa  302  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1611 aa  292  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  25.88 
 
 		 2144 aa  287  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.57 
 
 		 1560 aa  283  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  22.35 
 
 		 1620 aa  279  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1586 aa  275  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  25.61 
 
 		 931 aa  269  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1411 aa  269  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.23 
 
 		 1362 aa  268  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  24.66 
 
 		 1447 aa  266  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.78 
 
 		 1400 aa  266  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  25.06 
 
 		 1593 aa  266  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  24.11 
 
 		 1554 aa  264  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  24.96 
 
 		 1543 aa  264  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.96 
 
 		 1552 aa  264  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  23.52 
 
 		 1385 aa  261  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1410 aa  260  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  24.98 
 
 		 1539 aa  259  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  23.54 
 
 		 1348 aa  254  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1602 aa  254  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  23.26 
 
 		 1421 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  24.37 
 
 		 1539 aa  245  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.24 
 
 		 1579 aa  244  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.31 
 
 		 1409 aa  242  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1390 aa  242  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  24.79 
 
 		 1428 aa  240  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1402 aa  239  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1386 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.53 
 
 		 1568 aa  236  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.64 
 
 		 1446 aa  236  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1531 aa  235  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.29 
 
 		 1981 aa  232  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1419 aa  230  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.74 
 
 		 1429 aa  225  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  23.78 
 
 		 1418 aa  223  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  24.07 
 
 		 1379 aa  220  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1604 aa  219  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.24 
 
 		 924 aa  219  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.32 
 
 		 1384 aa  215  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  22.93 
 
 		 1494 aa  214  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.69 
 
 		 2035 aa  209  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1352 aa  209  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  24.01 
 
 		 1401 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 866 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  22.68 
 
 		 1583 aa  203  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  23.98 
 
 		 1422 aa  202  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1368 aa  201  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1654 aa  199  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1492 aa  197  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>