More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0346 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2035 aa  4103    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  31.4 
 
 		 2096 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0351  hypothetical protein  91.29 
 
 		 248 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.98 
 
 		 2149 aa  419  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  31.37 
 
 		 3027 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1917 aa  387  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  27.12 
 
 		 1271 aa  386  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1942 aa  382  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.66 
 
 		 2277 aa  380  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1669 aa  369  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  27.93 
 
 		 1840 aa  335  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1959 aa  315  5.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  24.5 
 
 		 1953 aa  311  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1352 aa  292  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  39.84 
 
 		 1977 aa  291  6e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1197 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 3689 aa  279  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.92 
 
 		 1485 aa  268  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  24.33 
 
 		 1626 aa  263  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  27.8 
 
 		 1485 aa  262  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1600 aa  259  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.95 
 
 		 1259 aa  250  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.7 
 
 		 1518 aa  242  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.51 
 
 		 1614 aa  241  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  23.79 
 
 		 1528 aa  239  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  22.66 
 
 		 1489 aa  239  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1620 aa  239  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11780  hypothetical protein  36.76 
 
 		 660 aa  237  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.31 
 
 		 1508 aa  235  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.22 
 
 		 1576 aa  234  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  23.65 
 
 		 1541 aa  233  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1541 aa  231  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1541 aa  231  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1541 aa  231  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1381 aa  231  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25.14 
 
 		 1488 aa  229  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1541 aa  229  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1541 aa  229  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  22.41 
 
 		 1586 aa  229  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.16 
 
 		 1467 aa  228  7e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  22.12 
 
 		 1593 aa  228  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  22.76 
 
 		 1531 aa  228  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1547 aa  228  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.85 
 
 		 1560 aa  227  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  24.26 
 
 		 1495 aa  224  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1611 aa  223  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  23.42 
 
 		 2731 aa  223  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  22.42 
 
 		 1543 aa  223  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1520 aa  222  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  24.28 
 
 		 1517 aa  221  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.38 
 
 		 1362 aa  221  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  23.71 
 
 		 1509 aa  221  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1552 aa  221  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.02 
 
 		 1550 aa  221  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1551 aa  220  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1487 aa  219  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1527 aa  219  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.59 
 
 		 1595 aa  219  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  24.61 
 
 		 1673 aa  219  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  23.71 
 
 		 1385 aa  218  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.58 
 
 		 1586 aa  218  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  22.74 
 
 		 1390 aa  218  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  24.91 
 
 		 1494 aa  217  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1494 aa  217  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.7 
 
 		 3193 aa  216  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1319 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  25.47 
 
 		 1565 aa  216  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  25.47 
 
 		 1565 aa  216  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25 
 
 		 1679 aa  215  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.19 
 
 		 1572 aa  214  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.56 
 
 		 1400 aa  214  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  24.69 
 
 		 2144 aa  214  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.2 
 
 		 1379 aa  214  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  24.25 
 
 		 1553 aa  213  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1386 aa  213  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  23.77 
 
 		 1579 aa  212  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  23.77 
 
 		 1428 aa  211  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.85 
 
 		 1568 aa  211  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  23.7 
 
 		 1530 aa  210  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1411 aa  210  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  22.79 
 
 		 1528 aa  208  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1495 aa  207  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.42 
 
 		 1381 aa  206  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1229 aa  205  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.27 
 
 		 1609 aa  204  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  22.74 
 
 		 1981 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  24.33 
 
 		 1639 aa  202  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 3273 aa  202  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1409 aa  202  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 2294 aa  202  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  22.43 
 
 		 1554 aa  199  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  24.68 
 
 		 1539 aa  199  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.07 
 
 		 2003 aa  198  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.82 
 
 		 1429 aa  197  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  23.39 
 
 		 1434 aa  196  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1368 aa  194  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.27 
 
 		 1527 aa  193  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.04 
 
 		 1446 aa  193  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1492 aa  192  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 1466 aa  193  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>