More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2951 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  40.98 
 
 		 1492 aa  1009    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  100 
 
 		 1539 aa  3169    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  59.89 
 
 		 1552 aa  1661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  56.14 
 
 		 1593 aa  1605    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  59.82 
 
 		 1543 aa  1659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  37.83 
 
 		 1579 aa  658    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  97.47 
 
 		 1539 aa  3058    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  41.19 
 
 		 1466 aa  1006    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  37.72 
 
 		 1428 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  36.14 
 
 		 1434 aa  735    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0462  YD repeat-containing protein  60.93 
 
 		 352 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1792  YD repeat-containing protein  61 
 
 		 348 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1609  YD repeat-containing protein  61 
 
 		 348 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  42.88 
 
 		 613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0412  YD repeat-containing protein  60.42 
 
 		 342 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0858889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1586 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  29.95 
 
 		 1259 aa  352  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1197 aa  343  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.78 
 
 		 1560 aa  337  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1520 aa  316  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.42 
 
 		 1568 aa  314  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.49 
 
 		 1485 aa  313  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1550 aa  311  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1368 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1551 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1547 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  33.07 
 
 		 693 aa  305  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  28.88 
 
 		 1488 aa  304  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1527 aa  304  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  27.73 
 
 		 1573 aa  300  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  27.55 
 
 		 1609 aa  296  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  28.6 
 
 		 1509 aa  296  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  27.4 
 
 		 1508 aa  295  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  25.3 
 
 		 1401 aa  293  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  27.25 
 
 		 1528 aa  290  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.75 
 
 		 1586 aa  288  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.65 
 
 		 1626 aa  285  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  26.85 
 
 		 1446 aa  283  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  26.67 
 
 		 1421 aa  282  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.34 
 
 		 1595 aa  282  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1554 aa  282  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  29.3 
 
 		 924 aa  280  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1611 aa  280  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.2 
 
 		 1495 aa  278  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1411 aa  278  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1400 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.21 
 
 		 1385 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.35 
 
 		 1489 aa  276  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  29.95 
 
 		 1620 aa  271  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  28.48 
 
 		 1348 aa  271  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.3 
 
 		 1362 aa  265  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.64 
 
 		 1409 aa  263  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.12 
 
 		 1572 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.53 
 
 		 1531 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1386 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26 
 
 		 1614 aa  256  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1583 aa  256  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  29.53 
 
 		 2144 aa  251  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1699 aa  251  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.15 
 
 		 1384 aa  250  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  25.71 
 
 		 1673 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.66 
 
 		 1602 aa  246  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1191  YD repeat-containing protein  54.7 
 
 		 425 aa  245  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  26.16 
 
 		 1359 aa  241  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25.38 
 
 		 1679 aa  238  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2826  substrate-binding repeat-containing protein  53.71 
 
 		 419 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1487 aa  234  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1419 aa  233  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1410 aa  233  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.5 
 
 		 1576 aa  231  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1604 aa  229  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  23.08 
 
 		 1494 aa  229  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1495 aa  229  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.67 
 
 		 1981 aa  229  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1600 aa  227  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1541 aa  225  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1541 aa  225  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1541 aa  225  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1553 aa  225  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1381 aa  224  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1418 aa  224  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1189 aa  224  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  26.96 
 
 		 1410 aa  224  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  25.72 
 
 		 1639 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 867 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  25.23 
 
 		 1494 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1494 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1541 aa  221  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 866 aa  221  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.79 
 
 		 2096 aa  220  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1541 aa  221  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.99 
 
 		 1528 aa  219  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1527 aa  219  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  26.55 
 
 		 1415 aa  219  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.29 
 
 		 1429 aa  218  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1541 aa  217  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.23 
 
 		 2149 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.91 
 
 		 2277 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1352 aa  213  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  27.25 
 
 		 1400 aa  211  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>