More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00283 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  99.09 
 
 		 1579 aa  1094    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  100 
 
 		 613 aa  1230    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  99.09 
 
 		 1428 aa  1094    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  59.01 
 
 		 1434 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  47.28 
 
 		 1543 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  47.28 
 
 		 1552 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  44.85 
 
 		 1593 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  42.88 
 
 		 1539 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  40.25 
 
 		 1466 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  40.25 
 
 		 1492 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  42.34 
 
 		 1539 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0462  YD repeat-containing protein  46.84 
 
 		 352 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1792  YD repeat-containing protein  46.55 
 
 		 348 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1609  YD repeat-containing protein  46.55 
 
 		 348 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0412  YD repeat-containing protein  46.49 
 
 		 342 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0858889  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  36.03 
 
 		 1488 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  34.11 
 
 		 1197 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  31.51 
 
 		 1259 aa  257  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  32.96 
 
 		 1485 aa  253  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  32.37 
 
 		 1560 aa  250  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  30.69 
 
 		 1528 aa  246  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  31.91 
 
 		 1547 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  31.49 
 
 		 1520 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  31.49 
 
 		 1550 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  33.33 
 
 		 1508 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  30.8 
 
 		 1495 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  31.24 
 
 		 1586 aa  226  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  30.48 
 
 		 1527 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  31.97 
 
 		 2144 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  30.48 
 
 		 1551 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  32.53 
 
 		 1528 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  31.92 
 
 		 1509 aa  219  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  30.74 
 
 		 1518 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  30.72 
 
 		 1401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  30.6 
 
 		 1573 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1352 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  28.25 
 
 		 1368 aa  203  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  28.26 
 
 		 2096 aa  200  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  31.72 
 
 		 1554 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.05 
 
 		 1609 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  29.76 
 
 		 1362 aa  197  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00291  RHS Repeat family  96.04 
 
 		 412 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  30.54 
 
 		 1421 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  31.92 
 
 		 1626 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.14 
 
 		 2277 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  28.76 
 
 		 1489 aa  193  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.86 
 
 		 3027 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  31.22 
 
 		 934 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.53 
 
 		 1271 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  40.16 
 
 		 693 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  29.66 
 
 		 2149 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1602 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  29.91 
 
 		 1576 aa  183  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  29.5 
 
 		 1531 aa  183  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  28.75 
 
 		 1446 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.7 
 
 		 1614 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 2035 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1191  YD repeat-containing protein  45.71 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1600 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1527 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1189 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2826  substrate-binding repeat-containing protein  45.59 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.23 
 
 		 1981 aa  170  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  29.39 
 
 		 1620 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1553 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.91 
 
 		 1611 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  36.33 
 
 		 422 aa  163  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1317 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1487 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1565 aa  161  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1565 aa  161  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.49 
 
 		 1429 aa  161  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  30 
 
 		 1494 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 1494 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  29.22 
 
 		 1583 aa  160  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1541 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1541 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1541 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1381 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1541 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1319 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1541 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  28.99 
 
 		 1639 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  29.72 
 
 		 1530 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1699 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  27.78 
 
 		 1447 aa  153  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  28.16 
 
 		 1348 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  29.62 
 
 		 1495 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1411 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1604 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.24 
 
 		 1384 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  28.99 
 
 		 1517 aa  147  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  28.3 
 
 		 1475 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  26.68 
 
 		 1422 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1419 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  27.55 
 
 		 1423 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  27.73 
 
 		 931 aa  144  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  27.94 
 
 		 1457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1386 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>