More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18610 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  100 
 
 		 2277 aa  4642    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  33.79 
 
 		 2096 aa  480  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  32.03 
 
 		 3027 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  32.09 
 
 		 1271 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 2035 aa  373  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.92 
 
 		 2149 aa  362  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1942 aa  313  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1669 aa  298  9e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1959 aa  297  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  30.99 
 
 		 1352 aa  291  8e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1917 aa  288  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1600 aa  287  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26.18 
 
 		 3689 aa  283  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.68 
 
 		 1840 aa  276  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.39 
 
 		 1953 aa  272  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.54 
 
 		 2731 aa  256  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1197 aa  239  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  29.24 
 
 		 1485 aa  239  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1527 aa  237  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1551 aa  236  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1547 aa  234  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.07 
 
 		 1489 aa  231  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1520 aa  227  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1552 aa  225  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  27.55 
 
 		 1543 aa  225  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1550 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.31 
 
 		 1485 aa  224  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.72 
 
 		 1560 aa  224  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.77 
 
 		 1579 aa  222  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1390 aa  221  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.77 
 
 		 1428 aa  221  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.48 
 
 		 1381 aa  221  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.86 
 
 		 1467 aa  220  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.49 
 
 		 1259 aa  218  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.65 
 
 		 1518 aa  218  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  23.84 
 
 		 1626 aa  216  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  25.91 
 
 		 1539 aa  216  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  25.91 
 
 		 1539 aa  215  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  29.07 
 
 		 1494 aa  215  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  29.07 
 
 		 1494 aa  215  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.33 
 
 		 1586 aa  214  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.33 
 
 		 1595 aa  213  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.13 
 
 		 1434 aa  213  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1611 aa  210  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  26.59 
 
 		 1609 aa  209  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  25.8 
 
 		 1517 aa  209  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  27.19 
 
 		 1593 aa  209  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  26.61 
 
 		 1495 aa  207  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.31 
 
 		 1528 aa  206  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  29.34 
 
 		 1488 aa  204  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.82 
 
 		 1576 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  24.81 
 
 		 1508 aa  203  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  98.02 
 
 		 225 aa  203  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  23.86 
 
 		 1509 aa  201  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 3273 aa  200  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1541 aa  199  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.21 
 
 		 1464 aa  199  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1541 aa  199  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1541 aa  199  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  24.53 
 
 		 1528 aa  199  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.74 
 
 		 1572 aa  199  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.87 
 
 		 1599 aa  199  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1487 aa  198  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1381 aa  198  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1541 aa  198  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1541 aa  198  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  23.3 
 
 		 1530 aa  197  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  25 
 
 		 1541 aa  197  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  25.9 
 
 		 2144 aa  197  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1531 aa  197  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1492 aa  196  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.93 
 
 		 3193 aa  195  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1466 aa  195  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  29.64 
 
 		 613 aa  194  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  30.63 
 
 		 934 aa  194  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  23.05 
 
 		 1639 aa  191  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1620 aa  190  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.57 
 
 		 1554 aa  189  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1602 aa  189  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1586 aa  188  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.79 
 
 		 1614 aa  188  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  24.65 
 
 		 6272 aa  187  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1583 aa  187  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.62 
 
 		 1981 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1495 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.46 
 
 		 1429 aa  185  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  29.51 
 
 		 927 aa  184  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  27.51 
 
 		 1415 aa  183  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  24.97 
 
 		 1447 aa  181  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1405 aa  181  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  26.93 
 
 		 1673 aa  179  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  27.19 
 
 		 1388 aa  179  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  29.54 
 
 		 1348 aa  179  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1418 aa  178  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  28.02 
 
 		 903 aa  178  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1410 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  26.88 
 
 		 1679 aa  177  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.03 
 
 		 1362 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1565 aa  176  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1565 aa  176  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>