More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1191 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2826  substrate-binding repeat-containing protein  98.57 
 
 		 419 aa  859    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1191  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 425 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1609  YD repeat-containing protein  98.58 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1792  YD repeat-containing protein  98.58 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0462  YD repeat-containing protein  98.1 
 
 		 352 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0412  YD repeat-containing protein  98.54 
 
 		 342 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0858889  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1053  hypothetical protein  64.75 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.74132  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1211  hypothetical protein  64.75 
 
 		 345 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0041  hypothetical protein  64.75 
 
 		 345 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0374  hypothetical protein  64.75 
 
 		 345 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117342  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  63.16 
 
 		 1543 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  63.16 
 
 		 1552 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  64.59 
 
 		 1593 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  54.7 
 
 		 1539 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  54.27 
 
 		 1539 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  45.97 
 
 		 1579 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  45.97 
 
 		 1428 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  45.71 
 
 		 613 aa  179  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1168  putative DNA-binding protein  83 
 
 		 197 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  41.43 
 
 		 1434 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  35.78 
 
 		 1492 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  35.32 
 
 		 1466 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2799  YD repeat-containing protein  80.77 
 
 		 124 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  32.77 
 
 		 1197 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3179  transposase  33.07 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.165493  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  35.75 
 
 		 1488 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  36.95 
 
 		 2144 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  35.06 
 
 		 1626 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  34.86 
 
 		 1550 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  30.43 
 
 		 2277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  36.27 
 
 		 1509 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  35.07 
 
 		 1565 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  35.07 
 
 		 1565 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  34.91 
 
 		 1611 aa  118  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  31 
 
 		 3027 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  31.65 
 
 		 1352 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  31.56 
 
 		 1609 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7313  hypothetical protein  31.17 
 
 		 358 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.0908026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  33.49 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  34.85 
 
 		 1620 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  35.15 
 
 		 1586 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  32.26 
 
 		 2149 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  32.02 
 
 		 1527 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  29.27 
 
 		 2035 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  33.33 
 
 		 1528 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  33.33 
 
 		 1576 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  33.49 
 
 		 1554 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1600 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  33.65 
 
 		 1572 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 934 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1551 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  27.98 
 
 		 1271 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  32.89 
 
 		 1259 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  34.68 
 
 		 903 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  34.27 
 
 		 889 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 1547 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  32.85 
 
 		 1568 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 1981 aa  103  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  31.58 
 
 		 1614 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  33.33 
 
 		 1485 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  32.85 
 
 		 924 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.75 
 
 		 2096 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  29.76 
 
 		 1495 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  32.08 
 
 		 1530 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  33.67 
 
 		 1560 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  31.67 
 
 		 1508 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  34.73 
 
 		 1485 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  30.81 
 
 		 1518 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  30.71 
 
 		 1679 aa  96.3  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1602 aa  95.9  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  29.02 
 
 		 1639 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  30.2 
 
 		 1673 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  28.63 
 
 		 1417 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  32.06 
 
 		 1429 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  31.47 
 
 		 1390 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1669 aa  94  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1699 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  31.13 
 
 		 1251 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  31.13 
 
 		 1199 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 1942 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  33.33 
 
 		 1397 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  29.51 
 
 		 1917 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  27.86 
 
 		 1415 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  32.21 
 
 		 1654 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  33.33 
 
 		 1365 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  31.7 
 
 		 1953 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  32.05 
 
 		 1377 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  32.05 
 
 		 1411 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  33.33 
 
 		 1397 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  34.8 
 
 		 1398 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  33.33 
 
 		 1394 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  31.55 
 
 		 2731 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  28.63 
 
 		 1489 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  33.33 
 
 		 1409 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  29.74 
 
 		 1531 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  33.33 
 
 		 1411 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  33.33 
 
 		 1399 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  32.63 
 
 		 1377 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  31.62 
 
 		 1411 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  32.84 
 
 		 1388 aa  89.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>