More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0012 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  100 
 
 
3027 aa  6060    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  34.48 
 
 
2096 aa  553  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  29.93 
 
 
2277 aa  413  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  29.04 
 
 
1959 aa  406  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  29.09 
 
 
1942 aa  404  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  32.18 
 
 
1271 aa  404  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  28.34 
 
 
1669 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  24.63 
 
 
3689 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.17 
 
 
2149 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  27.19 
 
 
1917 aa  373  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  28.24 
 
 
1840 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  29.55 
 
 
2035 aa  363  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.99 
 
 
1352 aa  319  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.46 
 
 
3273 aa  288  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  28.28 
 
 
1485 aa  278  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  27.76 
 
 
1953 aa  277  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  23.61 
 
 
2731 aa  273  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  29.43 
 
 
1600 aa  269  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.19 
 
 
2942 aa  251  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 
1197 aa  245  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  28.38 
 
 
3073 aa  240  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.32 
 
 
1528 aa  235  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  28.35 
 
 
1259 aa  235  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.52 
 
 
1488 aa  234  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  24.37 
 
 
1593 aa  232  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.58 
 
 
1485 aa  232  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  25.77 
 
 
1495 aa  231  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.17 
 
 
1552 aa  226  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  27.99 
 
 
1565 aa  224  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  27.99 
 
 
1565 aa  224  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.38 
 
 
1579 aa  224  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.76 
 
 
1518 aa  224  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  27.03 
 
 
1543 aa  224  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.38 
 
 
1428 aa  223  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.22 
 
 
1489 aa  222  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.95 
 
 
1467 aa  221  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  24.18 
 
 
1626 aa  220  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.99 
 
 
1611 aa  220  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.88 
 
 
1614 aa  218  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  27.1 
 
 
1508 aa  218  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  26.02 
 
 
6272 aa  216  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  25.17 
 
 
1586 aa  216  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.48 
 
 
1362 aa  215  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.42 
 
 
1527 aa  214  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.83 
 
 
1547 aa  213  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.11 
 
 
1572 aa  213  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  25.98 
 
 
1539 aa  214  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.53 
 
 
1509 aa  213  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  27.53 
 
 
1609 aa  213  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.32 
 
 
1551 aa  213  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24.23 
 
 
1520 aa  212  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.23 
 
 
1528 aa  211  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.49 
 
 
1381 aa  211  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  27.99 
 
 
2144 aa  211  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  24.22 
 
 
5189 aa  210  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  24.01 
 
 
5236 aa  209  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.27 
 
 
1981 aa  208  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.76 
 
 
1560 aa  208  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.31 
 
 
1576 aa  206  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  25.49 
 
 
1539 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  27.13 
 
 
1620 aa  205  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.08 
 
 
1434 aa  204  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.36 
 
 
1568 aa  202  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  23.72 
 
 
1550 aa  202  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.84 
 
 
1595 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.82 
 
 
1384 aa  201  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  24.66 
 
 
1541 aa  201  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  24.66 
 
 
1541 aa  201  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  24.66 
 
 
1541 aa  201  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.06 
 
 
1586 aa  200  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 
1531 aa  200  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  24.33 
 
 
1554 aa  200  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.6 
 
 
1541 aa  199  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.53 
 
 
1541 aa  199  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  24.53 
 
 
1381 aa  199  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.66 
 
 
1429 aa  199  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.25 
 
 
1517 aa  198  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.51 
 
 
1573 aa  198  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  24.68 
 
 
1602 aa  198  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  25.4 
 
 
1405 aa  197  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.58 
 
 
1541 aa  197  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.14 
 
 
2003 aa  196  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.54 
 
 
1487 aa  195  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.91 
 
 
2294 aa  195  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  25.64 
 
 
1388 aa  194  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.8 
 
 
1390 aa  193  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  26.04 
 
 
924 aa  191  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  24.33 
 
 
1553 aa  191  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  26.73 
 
 
613 aa  189  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.66 
 
 
3193 aa  189  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  27.11 
 
 
1319 aa  189  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 
1466 aa  188  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  25.91 
 
 
1415 aa  186  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  25.98 
 
 
1475 aa  186  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  27.33 
 
 
1495 aa  186  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.49 
 
 
1494 aa  183  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 
1494 aa  183  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  26.16 
 
 
1150 aa  182  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  23.3 
 
 
1394 aa  182  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.69 
 
 
1492 aa  182  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>