25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0041 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1211  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  706    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1053  hypothetical protein  99.71 
 
 
385 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.74132  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0041  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  706    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0374  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  706    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117342  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1191  YD repeat-containing protein  64.75 
 
 
425 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2826  substrate-binding repeat-containing protein  64.34 
 
 
419 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1168  putative DNA-binding protein  88.82 
 
 
197 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3179  transposase  42.77 
 
 
363 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.165493  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2799  YD repeat-containing protein  90.98 
 
 
124 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7313  hypothetical protein  39.37 
 
 
358 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.0908026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0889  hypothetical protein  40.16 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5052  protein of unknown function DUF746  36.13 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173533  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27120  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.540484  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26770  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24330  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24150  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.451022  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20710  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12940  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10580  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00897005  hitchhiker  0.0000000184484 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06960  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.482764  normal  0.143692 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04730  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.169012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04110  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.416207  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03560  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03470  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03170  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>