More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5510 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1390 aa  2833    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.73 
 
 		 2096 aa  284  8.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  28.17 
 
 		 1467 aa  254  7e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.77 
 
 		 2149 aa  253  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.58 
 
 		 2035 aa  253  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.6 
 
 		 1271 aa  249  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  28.95 
 
 		 1572 aa  249  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.19 
 
 		 1595 aa  246  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1352 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  29.98 
 
 		 903 aa  244  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  30.09 
 
 		 927 aa  241  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.17 
 
 		 1586 aa  239  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  29.9 
 
 		 913 aa  234  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.66 
 
 		 1614 aa  234  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.28 
 
 		 1576 aa  233  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  28.08 
 
 		 1381 aa  231  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.03 
 
 		 1362 aa  228  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  38.46 
 
 		 423 aa  228  9e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1531 aa  227  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1547 aa  225  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.26 
 
 		 2277 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1611 aa  221  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  29.27 
 
 		 889 aa  220  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 		 1600 aa  219  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1520 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.75 
 
 		 1384 aa  214  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.19 
 
 		 1609 aa  214  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1551 aa  210  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1197 aa  209  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  26.09 
 
 		 1421 aa  209  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.89 
 
 		 1560 aa  208  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.94 
 
 		 1508 aa  207  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.93 
 
 		 1488 aa  207  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1410 aa  205  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.46 
 
 		 1259 aa  204  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.04 
 
 		 1485 aa  202  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.79 
 
 		 1626 aa  202  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1550 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.52 
 
 		 1942 aa  198  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.69 
 
 		 1981 aa  197  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1527 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  24.95 
 
 		 1489 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1840 aa  197  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1411 aa  196  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.89 
 
 		 1577 aa  196  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.51 
 
 		 1429 aa  195  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  31.4 
 
 		 690 aa  195  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.58 
 
 		 1518 aa  194  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.51 
 
 		 3027 aa  194  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.23 
 
 		 1669 aa  193  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1917 aa  193  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.92 
 
 		 1528 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  26.31 
 
 		 1198 aa  192  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.24 
 
 		 1385 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1586 aa  190  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.26 
 
 		 1568 aa  188  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  26.4 
 
 		 924 aa  188  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.66 
 
 		 1379 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1400 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1386 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  26.76 
 
 		 1528 aa  187  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.75 
 
 		 1446 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1620 aa  185  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  25.96 
 
 		 1530 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.15 
 
 		 1959 aa  184  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1301 aa  183  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1433 aa  183  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1554 aa  182  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  28.01 
 
 		 738 aa  180  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.47 
 
 		 1494 aa  180  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1494 aa  180  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1419 aa  179  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.58 
 
 		 1509 aa  179  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.43 
 
 		 1434 aa  177  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1602 aa  176  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.57 
 
 		 1599 aa  175  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  26.64 
 
 		 867 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1409 aa  174  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  25.71 
 
 		 917 aa  174  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  25.03 
 
 		 1495 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1319 aa  172  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  24.08 
 
 		 1418 aa  171  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1495 aa  170  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  24.86 
 
 		 1517 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.74 
 
 		 1485 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1317 aa  168  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  25.91 
 
 		 866 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  24.71 
 
 		 1390 aa  166  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1149 aa  166  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1402 aa  165  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  24.35 
 
 		 1953 aa  165  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1487 aa  164  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  23.85 
 
 		 1466 aa  163  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  25.77 
 
 		 1423 aa  163  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  23.97 
 
 		 1348 aa  163  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  23.75 
 
 		 1573 aa  163  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  25.42 
 
 		 920 aa  162  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  24.82 
 
 		 1417 aa  162  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  25.79 
 
 		 931 aa  161  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  25 
 
 		 1541 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>