20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3179 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3179  transposase  100 
 
 		 363 aa  746    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.165493  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7313  hypothetical protein  56.91 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.0908026 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1053  hypothetical protein  42.73 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.74132  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0041  hypothetical protein  42.77 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0374  hypothetical protein  42.77 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117342  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1211  hypothetical protein  42.77 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1191  YD repeat-containing protein  33.07 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2826  substrate-binding repeat-containing protein  32.68 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1168  putative DNA-binding protein  39.02 
 
 		 197 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2799  YD repeat-containing protein  41.6 
 
 		 124 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5052  protein of unknown function DUF746  36.57 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0889  hypothetical protein  38.64 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0795  IS1 transposase  32.93 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3320  putative ISH4 transposase  28.09 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.498779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0871  putative ISH4 transposase  28.09 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1254  putative ISH4 transposase  28.09 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1476  putative ISH4 transposase  28.09 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1705  putative ISH4 transposase  28.09 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.99413  normal  0.0773274 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4200  Insertion element protein  26.04 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.913227  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2092  Insertion element protein  26.04 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>