More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2934 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  100 
 
 		 1953 aa  3901    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  28.62 
 
 		 2096 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  85.53 
 
 		 400 aa  364  9e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  29.18 
 
 		 1271 aa  363  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  24.73 
 
 		 2035 aa  331  7e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.13 
 
 		 2149 aa  315  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.85 
 
 		 1942 aa  311  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.55 
 
 		 3027 aa  303  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.61 
 
 		 2277 aa  282  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1959 aa  274  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1669 aa  265  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1917 aa  261  9e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1840 aa  258  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1600 aa  256  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.66 
 
 		 1352 aa  244  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 3689 aa  236  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.02 
 
 		 1381 aa  207  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  27.15 
 
 		 3273 aa  201  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.42 
 
 		 1560 aa  197  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1520 aa  196  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.23 
 
 		 2731 aa  194  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  26.7 
 
 		 1140 aa  191  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1551 aa  186  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.82 
 
 		 1259 aa  182  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.47 
 
 		 1550 aa  182  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1547 aa  181  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  27.08 
 
 		 2290 aa  181  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  26.53 
 
 		 1485 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1527 aa  178  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.81 
 
 		 1485 aa  177  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.62 
 
 		 1586 aa  175  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.6 
 
 		 1595 aa  175  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.58 
 
 		 1528 aa  173  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1602 aa  172  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  26.15 
 
 		 1495 aa  170  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.86 
 
 		 1579 aa  171  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.86 
 
 		 1428 aa  170  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1197 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.94 
 
 		 3073 aa  166  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.49 
 
 		 1488 aa  166  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1390 aa  165  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.92 
 
 		 1599 aa  165  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  27.87 
 
 		 2144 aa  165  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.98 
 
 		 1467 aa  164  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  25.61 
 
 		 2942 aa  164  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.9 
 
 		 903 aa  160  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1586 aa  160  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1487 aa  159  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.38 
 
 		 1518 aa  159  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.05 
 
 		 1576 aa  157  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  27.49 
 
 		 889 aa  157  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1541 aa  157  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.15 
 
 		 927 aa  157  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.16 
 
 		 1434 aa  157  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.31 
 
 		 1981 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 2003 aa  154  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1541 aa  154  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1541 aa  154  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.84 
 
 		 1609 aa  154  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.76 
 
 		 1528 aa  154  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1541 aa  154  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1541 aa  154  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1381 aa  153  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1541 aa  153  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  27.02 
 
 		 1489 aa  153  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.44 
 
 		 1429 aa  152  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1611 aa  152  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.89 
 
 		 1572 aa  152  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  27.45 
 
 		 2224 aa  152  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.68 
 
 		 1362 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  25.02 
 
 		 1554 aa  151  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1495 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.35 
 
 		 1517 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1558 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  31.78 
 
 		 2615 aa  151  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  27.84 
 
 		 1509 aa  150  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  24.65 
 
 		 1673 aa  150  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.11 
 
 		 2225 aa  150  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27.11 
 
 		 2246 aa  148  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  27.3 
 
 		 2224 aa  147  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.26 
 
 		 1543 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  27.3 
 
 		 2224 aa  147  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  27.48 
 
 		 1345 aa  147  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.14 
 
 		 1384 aa  147  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1552 aa  147  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  27.48 
 
 		 1345 aa  147  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  24.8 
 
 		 1679 aa  146  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.49 
 
 		 1614 aa  147  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1565 aa  146  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1565 aa  146  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  27 
 
 		 1654 aa  145  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  24.78 
 
 		 1508 aa  144  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  27.24 
 
 		 6272 aa  145  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.57 
 
 		 1348 aa  144  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  27.23 
 
 		 1008 aa  144  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  27.23 
 
 		 1008 aa  144  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  26.75 
 
 		 765 aa  144  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.78 
 
 		 1464 aa  142  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.46 
 
 		 1626 aa  141  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  27.73 
 
 		 741 aa  140  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>