More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0941 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  100 
 
 		 1467 aa  2980    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  32.69 
 
 		 1381 aa  492  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  31.87 
 
 		 1577 aa  489  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  40.31 
 
 		 903 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  36.27 
 
 		 913 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  39.47 
 
 		 889 aa  446  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  30.07 
 
 		 1433 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  34.88 
 
 		 917 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  34.54 
 
 		 920 aa  364  6e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  33.08 
 
 		 927 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1198 aa  326  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  28.33 
 
 		 2096 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  37.74 
 
 		 788 aa  298  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  36.87 
 
 		 764 aa  298  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  37.74 
 
 		 788 aa  298  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  38.19 
 
 		 705 aa  295  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  37.28 
 
 		 741 aa  290  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1301 aa  288  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1177 aa  281  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  33.23 
 
 		 818 aa  278  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  36.33 
 
 		 499 aa  271  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  28.16 
 
 		 1271 aa  269  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1352 aa  265  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  34.52 
 
 		 738 aa  264  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_003296  RS00945  rhs-related protein  34.83 
 
 		 587 aa  259  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  33.77 
 
 		 690 aa  254  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  28 
 
 		 1390 aa  251  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  28.32 
 
 		 1572 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.62 
 
 		 2149 aa  244  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.88 
 
 		 1576 aa  243  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  29.18 
 
 		 1611 aa  242  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.96 
 
 		 2035 aa  240  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.97 
 
 		 2277 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00576  RhsD protein  33.79 
 
 		 613 aa  232  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.11 
 
 		 1614 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1600 aa  229  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  32.87 
 
 		 605 aa  228  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.7 
 
 		 1362 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.67 
 
 		 1586 aa  221  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  28.43 
 
 		 1494 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  28.43 
 
 		 1494 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.17 
 
 		 1595 aa  221  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  26.75 
 
 		 1427 aa  220  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  28.12 
 
 		 1488 aa  214  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.49 
 
 		 1259 aa  214  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.2 
 
 		 3027 aa  212  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1547 aa  213  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24.47 
 
 		 1520 aa  212  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.15 
 
 		 1531 aa  208  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1554 aa  208  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.52 
 
 		 1560 aa  207  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1551 aa  205  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.19 
 
 		 1485 aa  204  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1550 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.81 
 
 		 1917 aa  203  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.85 
 
 		 1942 aa  202  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1487 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.02 
 
 		 1527 aa  199  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  27.01 
 
 		 1528 aa  198  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  24.42 
 
 		 1626 aa  196  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00943  rhs-related protein  29.36 
 
 		 681 aa  196  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.06 
 
 		 1508 aa  195  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  24.2 
 
 		 1892 aa  196  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1669 aa  195  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  26.81 
 
 		 1681 aa  194  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1390 aa  194  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1840 aa  193  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1197 aa  193  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1602 aa  193  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.62 
 
 		 1568 aa  192  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1402 aa  192  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1418 aa  191  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.24 
 
 		 1348 aa  189  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.28 
 
 		 1518 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.72 
 
 		 1485 aa  189  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  27.21 
 
 		 1359 aa  189  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.88 
 
 		 1981 aa  188  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1586 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  27.54 
 
 		 1008 aa  187  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  27.54 
 
 		 1008 aa  187  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.88 
 
 		 1429 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  25.88 
 
 		 1495 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  27.37 
 
 		 1673 aa  186  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  26.59 
 
 		 924 aa  186  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6263  YD repeat-containing protein  30.78 
 
 		 939 aa  185  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.79 
 
 		 1384 aa  184  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  27.58 
 
 		 1509 aa  183  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02144  putative RHS-related transmembrane protein  30.62 
 
 		 863 aa  181  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  23.76 
 
 		 1530 aa  181  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26 
 
 		 1434 aa  181  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  35.92 
 
 		 468 aa  181  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1959 aa  181  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  27.43 
 
 		 1345 aa  180  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  27.43 
 
 		 1345 aa  180  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  23.23 
 
 		 1553 aa  180  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.41 
 
 		 1541 aa  180  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.62 
 
 		 1489 aa  180  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.25 
 
 		 1541 aa  179  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.62 
 
 		 2731 aa  179  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  24.93 
 
 		 1517 aa  179  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>