292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1280 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2615 aa  5326    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  35.43 
 
 		 2076 aa  680    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  33.98 
 
 		 2290 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  32.74 
 
 		 2145 aa  671    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  36.23 
 
 		 2286 aa  683    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  31.66 
 
 		 2194 aa  578  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  32.66 
 
 		 2007 aa  554  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  32.39 
 
 		 2191 aa  546  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  28.36 
 
 		 2542 aa  386  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  34.31 
 
 		 1140 aa  267  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  36.96 
 
 		 614 aa  186  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  46.54 
 
 		 3273 aa  171  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  32.34 
 
 		 1953 aa  152  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.42 
 
 		 1391 aa  130  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  29.91 
 
 		 3689 aa  111  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  46.11 
 
 		 400 aa  103  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  37.09 
 
 		 2585 aa  102  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1834 aa  101  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0446  hedgehog/intein hint domain-containing protein  50.44 
 
 		 238 aa  99.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  26.49 
 
 		 2017 aa  95.5  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  25.51 
 
 		 2117 aa  90.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.58 
 
 		 2094 aa  82  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.83 
 
 		 2096 aa  76.3  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  39.13 
 
 		 474 aa  71.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2338  Hedgehog/intein hint domain protein  34.9 
 
 		 846 aa  71.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  39.33 
 
 		 3073 aa  71.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1628 aa  70.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  36.51 
 
 		 634 aa  70.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.96 
 
 		 1271 aa  69.7  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  39.13 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.25 
 
 		 1560 aa  68.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3597  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  69.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1488 aa  67.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  33.11 
 
 		 1568 aa  67.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  38.26 
 
 		 554 aa  67.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.27 
 
 		 3027 aa  67.4  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  34.81 
 
 		 2486 aa  66.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  28.85 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.13 
 
 		 1959 aa  66.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.39 
 
 		 1485 aa  64.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  32.28 
 
 		 334 aa  64.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1620 aa  63.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  33.11 
 
 		 251 aa  63.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  23.43 
 
 		 2138 aa  62.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  32.28 
 
 		 566 aa  62.8  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  32.37 
 
 		 522 aa  62  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  34.07 
 
 		 890 aa  62.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 488 aa  62.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  28.21 
 
 		 3193 aa  62.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  31.01 
 
 		 558 aa  62.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  33.61 
 
 		 2035 aa  62.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1854 aa  61.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  24.17 
 
 		 3333 aa  61.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  41.98 
 
 		 520 aa  62  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  35.77 
 
 		 423 aa  61.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  30.38 
 
 		 561 aa  61.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.4 
 
 		 2731 aa  60.5  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  39.02 
 
 		 2494 aa  60.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  27.98 
 
 		 333 aa  60.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  39.25 
 
 		 2374 aa  60.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  26.74 
 
 		 1411 aa  60.1  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.88 
 
 		 1072 aa  60.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  30.77 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  30.38 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  36.23 
 
 		 628 aa  59.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  26.22 
 
 		 1411 aa  59.7  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  26.22 
 
 		 1397 aa  59.3  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  36 
 
 		 2762 aa  58.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  40.74 
 
 		 316 aa  58.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  30.19 
 
 		 613 aa  59.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  30.38 
 
 		 401 aa  58.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  30.64 
 
 		 469 aa  58.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  40.74 
 
 		 298 aa  58.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.07 
 
 		 933 aa  58.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  40.74 
 
 		 298 aa  58.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  36.25 
 
 		 2428 aa  58.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1517 aa  58.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  28.48 
 
 		 450 aa  58.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  39.02 
 
 		 2942 aa  58.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  33.6 
 
 		 492 aa  57.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  26.26 
 
 		 1397 aa  57.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  22.5 
 
 		 3320 aa  57.8  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.54 
 
 		 1362 aa  57.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1550 aa  57.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  22.83 
 
 		 2448 aa  57.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  31.45 
 
 		 471 aa  57.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  28.48 
 
 		 615 aa  57.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  34.13 
 
 		 414 aa  57.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  37.21 
 
 		 732 aa  57.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  30.38 
 
 		 408 aa  57  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.64 
 
 		 2277 aa  57  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  28.48 
 
 		 615 aa  57  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  34.26 
 
 		 446 aa  56.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1520 aa  56.2  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  35.94 
 
 		 489 aa  56.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  35.11 
 
 		 374 aa  56.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1547 aa  56.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  30.34 
 
 		 2413 aa  56.2  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  34.96 
 
 		 2225 aa  56.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  29.92 
 
 		 426 aa  55.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>