More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1558 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 3320 aa  6699    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  96.63 
 
 		 1126 aa  1670    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  68.47 
 
 		 1140 aa  1151    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  67.28 
 
 		 1488 aa  1549    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  29.23 
 
 		 3456 aa  491  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1566  hypothetical protein  65.57 
 
 		 360 aa  241  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0920602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1834 aa  181  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25 
 
 		 2017 aa  166  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  24.86 
 
 		 2117 aa  164  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  23.75 
 
 		 2138 aa  164  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.21 
 
 		 2094 aa  162  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 927 aa  158  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.29 
 
 		 2096 aa  157  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  23.8 
 
 		 2443 aa  145  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  25.32 
 
 		 2479 aa  145  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.28 
 
 		 690 aa  143  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  26.14 
 
 		 2534 aa  137  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  24.97 
 
 		 1600 aa  131  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  22.66 
 
 		 2035 aa  126  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  22.56 
 
 		 2059 aa  123  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1352 aa  122  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  23.67 
 
 		 2510 aa  120  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  23.85 
 
 		 903 aa  119  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1517 aa  117  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  25 
 
 		 2698 aa  117  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  22.51 
 
 		 764 aa  116  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  21.99 
 
 		 2076 aa  115  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  25.07 
 
 		 952 aa  114  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.8 
 
 		 1576 aa  111  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  23.3 
 
 		 889 aa  110  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.2 
 
 		 2458 aa  107  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  22.09 
 
 		 788 aa  107  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  22.09 
 
 		 788 aa  107  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.05 
 
 		 2417 aa  107  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  23.03 
 
 		 1976 aa  107  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  22.06 
 
 		 1586 aa  105  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  22.06 
 
 		 1595 aa  104  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.63 
 
 		 1467 aa  102  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  24.34 
 
 		 2652 aa  100  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  22.13 
 
 		 1614 aa  101  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  22.67 
 
 		 705 aa  100  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  22.78 
 
 		 955 aa  99.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  27.13 
 
 		 954 aa  97.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  27.13 
 
 		 954 aa  97.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  27.13 
 
 		 954 aa  97.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.52 
 
 		 1551 aa  97.1  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.31 
 
 		 741 aa  96.7  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  25.14 
 
 		 980 aa  96.3  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  22.09 
 
 		 924 aa  95.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  22.85 
 
 		 2277 aa  95.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  22.33 
 
 		 1527 aa  94.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  21.93 
 
 		 956 aa  94.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  22.38 
 
 		 1433 aa  93.2  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  21.03 
 
 		 1381 aa  92.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  23.44 
 
 		 927 aa  92.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.96 
 
 		 3073 aa  91.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  23.98 
 
 		 1577 aa  91.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  22.96 
 
 		 1271 aa  90.1  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  22.19 
 
 		 1547 aa  90.1  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  21.22 
 
 		 1602 aa  89.7  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  23.19 
 
 		 881 aa  89.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  23.6 
 
 		 920 aa  89.7  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  33.19 
 
 		 628 aa  89  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.8 
 
 		 1485 aa  89.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  26.78 
 
 		 994 aa  88.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.17 
 
 		 1611 aa  88.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  23.37 
 
 		 917 aa  87.8  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  23.61 
 
 		 468 aa  87  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  24.22 
 
 		 940 aa  87  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  23.92 
 
 		 920 aa  85.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.09 
 
 		 3027 aa  85.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  25.54 
 
 		 939 aa  84.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  23.19 
 
 		 989 aa  85.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  33.83 
 
 		 2558 aa  85.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  24.37 
 
 		 1732 aa  85.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  22.57 
 
 		 886 aa  84.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  22.46 
 
 		 1609 aa  84  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  22.14 
 
 		 1568 aa  84  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  22.86 
 
 		 1550 aa  83.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  22.43 
 
 		 1418 aa  83.2  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  26.08 
 
 		 678 aa  82.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1409 aa  82.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  22.64 
 
 		 867 aa  81.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  24.91 
 
 		 958 aa  81.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  23.17 
 
 		 2413 aa  80.9  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  22.25 
 
 		 1518 aa  80.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  24.91 
 
 		 962 aa  79.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  22.68 
 
 		 605 aa  79.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  24.91 
 
 		 962 aa  79.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1317 aa  79.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  21.47 
 
 		 1573 aa  78.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  23.57 
 
 		 2349 aa  78.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  21.18 
 
 		 1390 aa  78.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  24.21 
 
 		 929 aa  78.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  22.6 
 
 		 1402 aa  77.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  24.21 
 
 		 958 aa  77.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  24.42 
 
 		 952 aa  77.4  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.52 
 
 		 1669 aa  76.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.54 
 
 		 1942 aa  76.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  21.72 
 
 		 1840 aa  76.3  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>