More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1237 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 628 aa  1275    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  52.99 
 
 		 1517 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  37.36 
 
 		 1834 aa  221  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  29.72 
 
 		 1976 aa  170  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  32.94 
 
 		 2094 aa  164  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  32.49 
 
 		 2017 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  39.53 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  38.11 
 
 		 474 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  31.35 
 
 		 2416 aa  138  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  30.8 
 
 		 1381 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  31.55 
 
 		 2428 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  28.02 
 
 		 927 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  28.43 
 
 		 738 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  29.11 
 
 		 690 aa  124  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.77 
 
 		 2032 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  30.09 
 
 		 1271 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  48.59 
 
 		 554 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.12 
 
 		 1433 aa  114  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1854 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1352 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.99 
 
 		 1614 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  26.99 
 
 		 605 aa  107  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.65 
 
 		 1572 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  26.33 
 
 		 2437 aa  104  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1611 aa  103  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.54 
 
 		 1576 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  56.12 
 
 		 232 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1825 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1806 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1825 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  28.69 
 
 		 2413 aa  101  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  29.33 
 
 		 722 aa  101  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 2401 aa  101  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  26.99 
 
 		 1427 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1959 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  25.56 
 
 		 764 aa  100  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.54 
 
 		 2096 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.62 
 
 		 2031 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  29.07 
 
 		 1600 aa  99.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.2 
 
 		 1586 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  31.82 
 
 		 2117 aa  98.2  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  25.62 
 
 		 2031 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  29.55 
 
 		 2942 aa  97.8  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 2031 aa  97.8  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 2283 aa  97.4  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.61 
 
 		 1595 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  29.93 
 
 		 2294 aa  97.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  27.1 
 
 		 788 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  27.1 
 
 		 788 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  28.28 
 
 		 2658 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  27.73 
 
 		 2443 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  27.36 
 
 		 2513 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1126 aa  94.7  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  24.03 
 
 		 2402 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1198 aa  94.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.08 
 
 		 2149 aa  94.7  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  25.92 
 
 		 2448 aa  94  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  24.89 
 
 		 3456 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  27.95 
 
 		 2035 aa  92.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  29.07 
 
 		 2349 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  31.15 
 
 		 1345 aa  92  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  31.15 
 
 		 1345 aa  92  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1917 aa  91.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  24.77 
 
 		 705 aa  91.3  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  30.89 
 
 		 1008 aa  90.9  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  30.89 
 
 		 1008 aa  90.9  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  26.91 
 
 		 741 aa  90.1  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  41.53 
 
 		 2494 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.47 
 
 		 903 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  48.57 
 
 		 299 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1623 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  33.19 
 
 		 3320 aa  89.7  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1172 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  28.16 
 
 		 2076 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  26.1 
 
 		 1467 aa  89  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.73 
 
 		 1599 aa  88.2  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  26.48 
 
 		 2497 aa  87.8  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  24.84 
 
 		 2510 aa  87.4  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.02 
 
 		 1362 aa  87  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1157 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1942 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1411 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1840 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  25.51 
 
 		 2762 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  29.33 
 
 		 1073 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  30.63 
 
 		 2138 aa  84.7  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  32.02 
 
 		 1753 aa  84  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0045  hypothetical protein  41.44 
 
 		 302 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  29.78 
 
 		 1140 aa  82.4  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  22.93 
 
 		 1550 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1147 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  29.55 
 
 		 3073 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.42 
 
 		 1953 aa  82.4  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  30.6 
 
 		 2007 aa  81.6  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.02 
 
 		 1551 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  26.76 
 
 		 1577 aa  81.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  26.65 
 
 		 1998 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.22 
 
 		 1560 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  29.03 
 
 		 1628 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27.07 
 
 		 2246 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>