More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0409 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  53.03 
 
 		 954 aa  661    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  53.03 
 
 		 954 aa  661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  51.03 
 
 		 962 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  88.92 
 
 		 921 aa  1272    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  74.71 
 
 		 952 aa  1384    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  53.03 
 
 		 954 aa  661    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  51.03 
 
 		 958 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  78.27 
 
 		 952 aa  1491    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  51.03 
 
 		 962 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  100 
 
 		 958 aa  1987    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  95.77 
 
 		 910 aa  1300    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  51.02 
 
 		 980 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  92.06 
 
 		 929 aa  1335    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  51.91 
 
 		 994 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  52.07 
 
 		 852 aa  623  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  46.11 
 
 		 952 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  42.66 
 
 		 989 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  42.42 
 
 		 881 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  40.85 
 
 		 2417 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  41.21 
 
 		 2458 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  42.2 
 
 		 955 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  42.03 
 
 		 940 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  40.44 
 
 		 956 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  41.6 
 
 		 920 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  41.04 
 
 		 886 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  41.04 
 
 		 939 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  39.22 
 
 		 927 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  38.85 
 
 		 923 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  39.05 
 
 		 922 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  37.61 
 
 		 942 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  36.03 
 
 		 893 aa  369  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  36.16 
 
 		 891 aa  366  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  35.8 
 
 		 944 aa  360  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  33.19 
 
 		 2558 aa  348  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  33.48 
 
 		 2554 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  34.14 
 
 		 928 aa  328  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  32.37 
 
 		 2698 aa  291  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  30.73 
 
 		 2652 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  30.28 
 
 		 2534 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  30.64 
 
 		 2443 aa  255  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  32.57 
 
 		 2510 aa  244  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  28.67 
 
 		 2479 aa  237  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  36.63 
 
 		 334 aa  130  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  26.22 
 
 		 3456 aa  111  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.59 
 
 		 1976 aa  108  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  31.85 
 
 		 1935 aa  97.8  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  24.21 
 
 		 3320 aa  94  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1126 aa  94  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  26.14 
 
 		 2145 aa  90.5  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 2003 aa  88.2  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  26.95 
 
 		 1338 aa  87  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  25.42 
 
 		 2076 aa  84.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  36.3 
 
 		 1464 aa  82  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1917 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.92 
 
 		 690 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  32.54 
 
 		 909 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1600 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1409 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.53 
 
 		 2017 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  27.44 
 
 		 927 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26 
 
 		 3193 aa  75.1  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1352 aa  74.7  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1386 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  22.28 
 
 		 867 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.5 
 
 		 2096 aa  74.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  25.61 
 
 		 1140 aa  73.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  28.1 
 
 		 1381 aa  73.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.47 
 
 		 903 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  22.52 
 
 		 1599 aa  71.6  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1942 aa  71.6  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  23.81 
 
 		 1577 aa  71.2  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 972 aa  71.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  23.97 
 
 		 480 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.99 
 
 		 1560 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1959 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.63 
 
 		 1385 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1147 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.76 
 
 		 1384 aa  70.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.85 
 
 		 678 aa  69.7  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  24.7 
 
 		 1673 aa  69.3  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.86 
 
 		 1595 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1400 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.86 
 
 		 1586 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.2 
 
 		 1466 aa  68.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  37.27 
 
 		 1892 aa  68.2  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  32.31 
 
 		 2294 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.47 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  23.78 
 
 		 1528 aa  67.8  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1492 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  31.85 
 
 		 740 aa  67.4  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  34.4 
 
 		 1490 aa  67.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  23.4 
 
 		 1418 aa  67  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1834 aa  67  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1550 aa  67  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1840 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  24.15 
 
 		 583 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  26.52 
 
 		 414 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.15 
 
 		 1551 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1488 aa  66.2  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>