296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4340 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  52.65 
 
 		 922 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  100 
 
 		 940 aa  1947    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  72.23 
 
 		 886 aa  976    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  47.48 
 
 		 927 aa  803    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  52.99 
 
 		 923 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  76.42 
 
 		 920 aa  1036    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  90.12 
 
 		 939 aa  1215    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  73.36 
 
 		 955 aa  979    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  73.51 
 
 		 881 aa  971    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  51.8 
 
 		 956 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  46.4 
 
 		 893 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  45.1 
 
 		 942 aa  525  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  45.07 
 
 		 989 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  44.41 
 
 		 2458 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  44.38 
 
 		 2417 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  40.18 
 
 		 921 aa  469  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  41.55 
 
 		 929 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  42.73 
 
 		 910 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  43.13 
 
 		 952 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  41.97 
 
 		 952 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  42.69 
 
 		 952 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  41.54 
 
 		 954 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  41.54 
 
 		 954 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  41.54 
 
 		 954 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  42.03 
 
 		 958 aa  446  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  41.34 
 
 		 962 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  41.69 
 
 		 980 aa  432  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  41.34 
 
 		 962 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  41.34 
 
 		 958 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  40.68 
 
 		 994 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  40.74 
 
 		 852 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  39.78 
 
 		 891 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  39.27 
 
 		 928 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  37.28 
 
 		 944 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  31.99 
 
 		 2558 aa  317  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  33.33 
 
 		 2554 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  33.28 
 
 		 2698 aa  288  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  31.56 
 
 		 2443 aa  258  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  30.29 
 
 		 2534 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  33.24 
 
 		 2510 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  32.06 
 
 		 2479 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  31.11 
 
 		 2652 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  27.46 
 
 		 3456 aa  108  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  26.17 
 
 		 1976 aa  106  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.89 
 
 		 690 aa  102  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 927 aa  101  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.09 
 
 		 2017 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  23.78 
 
 		 1140 aa  90.5  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  23.85 
 
 		 1488 aa  89.4  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.55 
 
 		 1464 aa  89.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  33.64 
 
 		 334 aa  89  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 3320 aa  87  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1126 aa  87  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.79 
 
 		 2035 aa  87  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.71 
 
 		 1599 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.52 
 
 		 1271 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  26.26 
 
 		 2138 aa  85.5  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.81 
 
 		 903 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1600 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  23.91 
 
 		 2076 aa  82  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.29 
 
 		 1942 aa  82  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  24.44 
 
 		 1140 aa  81.6  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  23.85 
 
 		 2762 aa  81.3  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1917 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  22.11 
 
 		 3193 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.23 
 
 		 1467 aa  79  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.84 
 
 		 1840 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.29 
 
 		 738 aa  78.2  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.19 
 
 		 1576 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.48 
 
 		 1352 aa  78.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  24.39 
 
 		 1421 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  24.96 
 
 		 741 aa  77.8  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  21.74 
 
 		 1834 aa  77.4  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  23.77 
 
 		 2003 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  27.83 
 
 		 480 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 451 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3899  hypothetical protein  26.77 
 
 		 917 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.88 
 
 		 482 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.4 
 
 		 1614 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  29.48 
 
 		 867 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.63 
 
 		 1959 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1386 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.89 
 
 		 2094 aa  73.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  27.6 
 
 		 2145 aa  73.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1611 aa  72.4  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  29.39 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1411 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  27.55 
 
 		 1710 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.6 
 
 		 1572 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.83 
 
 		 678 aa  70.1  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  23.79 
 
 		 1338 aa  70.1  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.21 
 
 		 1586 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.07 
 
 		 1595 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  23.07 
 
 		 788 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  23.07 
 
 		 788 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1409 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  28.51 
 
 		 1429 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  28 
 
 		 1381 aa  68.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1623 aa  68.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  23.84 
 
 		 1577 aa  68.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>