More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1893 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  56.95 
 
 		 2443 aa  2388    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  100 
 
 		 2510 aa  5078    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  37.65 
 
 		 2534 aa  1424    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  34.06 
 
 		 2554 aa  1091    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  35.2 
 
 		 2558 aa  783    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  32.57 
 
 		 2698 aa  843    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  47.74 
 
 		 2652 aa  1894    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  54.64 
 
 		 2479 aa  2249    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  30.51 
 
 		 1505 aa  549  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  30.17 
 
 		 1489 aa  533  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  30.96 
 
 		 1446 aa  513  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  31.14 
 
 		 1447 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  30.38 
 
 		 1528 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  29.11 
 
 		 1485 aa  503  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  31.49 
 
 		 1496 aa  504  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  30.04 
 
 		 2417 aa  457  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  30.04 
 
 		 2458 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  29.68 
 
 		 1540 aa  439  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  29.68 
 
 		 1540 aa  439  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  29.68 
 
 		 1540 aa  439  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1488 aa  380  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  31.36 
 
 		 1976 aa  366  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  35.1 
 
 		 939 aa  270  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  34.4 
 
 		 927 aa  263  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  32.44 
 
 		 881 aa  262  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  32.71 
 
 		 886 aa  257  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  32.18 
 
 		 920 aa  252  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  33.24 
 
 		 940 aa  251  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  32.49 
 
 		 955 aa  250  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  31.33 
 
 		 989 aa  248  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  32.84 
 
 		 952 aa  235  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  28.76 
 
 		 2031 aa  234  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.76 
 
 		 2031 aa  233  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.76 
 
 		 2031 aa  233  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.94 
 
 		 2032 aa  233  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  32.86 
 
 		 921 aa  232  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  32.86 
 
 		 952 aa  229  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  32.83 
 
 		 922 aa  229  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  32.51 
 
 		 929 aa  228  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  32.57 
 
 		 958 aa  227  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  32.42 
 
 		 910 aa  224  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  31.92 
 
 		 956 aa  221  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  31.17 
 
 		 952 aa  211  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  30.43 
 
 		 980 aa  209  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  31.59 
 
 		 923 aa  206  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  32.04 
 
 		 994 aa  206  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  32.21 
 
 		 954 aa  205  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  32.21 
 
 		 954 aa  205  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  32.21 
 
 		 954 aa  205  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.69 
 
 		 1825 aa  205  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.69 
 
 		 1825 aa  205  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  31.55 
 
 		 958 aa  204  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  31.55 
 
 		 962 aa  204  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  31.55 
 
 		 962 aa  204  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.49 
 
 		 1806 aa  200  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  32.38 
 
 		 944 aa  197  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  32.39 
 
 		 852 aa  194  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  30.48 
 
 		 891 aa  191  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  28.22 
 
 		 928 aa  188  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  30.48 
 
 		 942 aa  181  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  30.57 
 
 		 893 aa  174  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  25.59 
 
 		 2059 aa  143  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  25.31 
 
 		 2035 aa  141  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2959  hypothetical protein  71.95 
 
 		 119 aa  121  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.650705 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  23.4 
 
 		 1126 aa  120  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  23.67 
 
 		 3320 aa  119  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27 
 
 		 1600 aa  107  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  23.7 
 
 		 1488 aa  107  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  26.48 
 
 		 3456 aa  107  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.48 
 
 		 1352 aa  106  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.33 
 
 		 2094 aa  105  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1602 aa  103  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1834 aa  98.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 690 aa  98.2  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  23.86 
 
 		 1140 aa  97.8  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.96 
 
 		 2096 aa  95.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 927 aa  94.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  28.46 
 
 		 1338 aa  92.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  28.23 
 
 		 2428 aa  91.3  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 628 aa  87.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.38 
 
 		 1611 aa  87  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  29.36 
 
 		 1572 aa  87  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  29.48 
 
 		 1140 aa  86.3  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  25.16 
 
 		 1998 aa  85.9  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 2035 aa  84.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.74 
 
 		 1568 aa  84  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  25.49 
 
 		 2497 aa  84  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  29.02 
 
 		 1595 aa  83.2  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  29.13 
 
 		 1586 aa  82  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2612  hypothetical protein  72.22 
 
 		 103 aa  82.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.7 
 
 		 1614 aa  82.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  28.81 
 
 		 1599 aa  81.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  23.89 
 
 		 2225 aa  81.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.49 
 
 		 1509 aa  80.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  27.03 
 
 		 3193 aa  80.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  27.69 
 
 		 2658 aa  80.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  28.3 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  26.52 
 
 		 2076 aa  79.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.97 
 
 		 903 aa  79.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  29.19 
 
 		 1892 aa  79.3  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>