241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0382 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  52.62 
 
 		 910 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  50.27 
 
 		 952 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  80 
 
 		 954 aa  1148    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 852 aa  1753    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  80 
 
 		 954 aa  1148    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  52.07 
 
 		 958 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  53.14 
 
 		 952 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  52.16 
 
 		 929 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  51.74 
 
 		 921 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  73.74 
 
 		 962 aa  1010    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  73.74 
 
 		 958 aa  1009    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  73.74 
 
 		 962 aa  1010    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  80 
 
 		 954 aa  1148    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  74.31 
 
 		 980 aa  1024    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  80.12 
 
 		 994 aa  1113    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  52.82 
 
 		 952 aa  633  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  44.82 
 
 		 989 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  43.42 
 
 		 2417 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  43.75 
 
 		 2458 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  40.74 
 
 		 940 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  39.65 
 
 		 956 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  40.87 
 
 		 927 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  39.61 
 
 		 939 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  40.7 
 
 		 955 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  39.45 
 
 		 886 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  41.06 
 
 		 881 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  40.72 
 
 		 923 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  38.57 
 
 		 920 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  39.06 
 
 		 922 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  73.47 
 
 		 334 aa  353  7e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  36.38 
 
 		 891 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  36.35 
 
 		 893 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  36.12 
 
 		 942 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  35.4 
 
 		 944 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  33.14 
 
 		 2558 aa  328  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  33.53 
 
 		 2554 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  34.82 
 
 		 928 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  32.39 
 
 		 2698 aa  263  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  30.66 
 
 		 2534 aa  259  1e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  31.24 
 
 		 2652 aa  230  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  31.6 
 
 		 2443 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  32.39 
 
 		 2510 aa  221  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  28.43 
 
 		 2479 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1126 aa  101  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  26.74 
 
 		 3320 aa  98.2  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1488 aa  94.4  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1140 aa  92.4  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  25.46 
 
 		 3456 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1600 aa  79  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  44.57 
 
 		 1935 aa  76.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  36.89 
 
 		 1464 aa  72  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  24.6 
 
 		 2076 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.5 
 
 		 2017 aa  68.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 2294 aa  67.4  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  25.2 
 
 		 2145 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.65 
 
 		 1976 aa  66.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.19 
 
 		 927 aa  66.6  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1834 aa  65.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.65 
 
 		 1429 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  25.19 
 
 		 1338 aa  65.5  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  23.08 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  22.75 
 
 		 1348 aa  62.4  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  26.16 
 
 		 2191 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  24.91 
 
 		 1938 aa  61.6  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  35.83 
 
 		 1710 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  26.04 
 
 		 1140 aa  60.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.87 
 
 		 2225 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  28.7 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  31.53 
 
 		 1599 aa  59.3  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  25.45 
 
 		 2290 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  35.09 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  35.09 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  35.09 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  23.01 
 
 		 1577 aa  58.9  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  25.59 
 
 		 1639 aa  58.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  39 
 
 		 1147 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  34.43 
 
 		 1520 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.25 
 
 		 1981 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  36.04 
 
 		 1892 aa  57.8  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1433 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1583 aa  57.4  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.84 
 
 		 1568 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1547 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  27.12 
 
 		 1957 aa  57  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1409 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  27.8 
 
 		 867 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  24.36 
 
 		 1912 aa  56.2  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.99 
 
 		 1560 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1531 aa  56.6  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  30.05 
 
 		 335 aa  56.6  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  29.13 
 
 		 1381 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  26.96 
 
 		 535 aa  55.8  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1411 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  37.23 
 
 		 284 aa  56.2  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1959 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1386 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0350  RHS protein  28.65 
 
 		 307 aa  55.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  33.91 
 
 		 311 aa  55.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  26.4 
 
 		 480 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  33.93 
 
 		 1550 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>