More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2106 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  684    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  79.14 
 
 		 1681 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  45.64 
 
 		 1599 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  38.25 
 
 		 1710 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  39.51 
 
 		 1558 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  31.9 
 
 		 451 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  32.82 
 
 		 480 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  34.36 
 
 		 561 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  28.47 
 
 		 1568 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  31.37 
 
 		 867 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  32.82 
 
 		 866 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  34.21 
 
 		 924 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1409 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  32.31 
 
 		 1411 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  35.88 
 
 		 2831 aa  86.3  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  30.37 
 
 		 1600 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  32.16 
 
 		 1385 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  31.34 
 
 		 1352 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  35.67 
 
 		 2961 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1400 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1531 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  35.23 
 
 		 1576 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  33.87 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  31.97 
 
 		 1464 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  31.77 
 
 		 1402 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.54 
 
 		 1429 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  32.12 
 
 		 1390 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1763 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1611 aa  79.3  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  32.29 
 
 		 1418 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  31.66 
 
 		 1386 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  32.24 
 
 		 1379 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  32.43 
 
 		 1419 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  31.58 
 
 		 1362 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  31.28 
 
 		 1384 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  29 
 
 		 1338 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.41 
 
 		 1981 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  33.33 
 
 		 2277 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  37.38 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0350  RHS protein  33.33 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  31.09 
 
 		 1586 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  35.52 
 
 		 1008 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  31.09 
 
 		 1595 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  35.52 
 
 		 1008 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  32.18 
 
 		 690 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  36.22 
 
 		 903 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  33.52 
 
 		 1572 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1433 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  30.19 
 
 		 909 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  30.66 
 
 		 869 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  31.53 
 
 		 927 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  35.51 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1410 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  37.96 
 
 		 1935 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  31.61 
 
 		 1614 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  28.86 
 
 		 2294 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  31.61 
 
 		 678 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3469  hypothetical protein  30.59 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1602  hypothetical protein  28 
 
 		 753 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  31.25 
 
 		 1381 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1942 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2293  RhsD protein  51.61 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1840 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  26.98 
 
 		 605 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  39.05 
 
 		 972 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2213  RhsD protein precursor  55.17 
 
 		 207 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017753  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  28.04 
 
 		 1912 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1917 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  34.04 
 
 		 1345 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  36.29 
 
 		 1560 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  34.04 
 
 		 1345 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  27.8 
 
 		 1517 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  26.46 
 
 		 1929 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  29.17 
 
 		 1467 aa  67  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  31.03 
 
 		 1998 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  30.48 
 
 		 2003 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1550 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  31.41 
 
 		 1348 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  31.48 
 
 		 1405 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2441  hypothetical protein  50.85 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  34.62 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  28.06 
 
 		 1957 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  26.11 
 
 		 1991 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  31.15 
 
 		 1428 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  35.09 
 
 		 1626 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  31.48 
 
 		 1400 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.86 
 
 		 1527 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1541 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  30.88 
 
 		 1485 aa  63.2  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1541 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1541 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1541 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  36.79 
 
 		 1410 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1541 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  29.65 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1541 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  32.39 
 
 		 1488 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1520 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 740 aa  62.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1381 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>