More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2107 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  46.88 
 
 		 1368 aa  895    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  44.64 
 
 		 1710 aa  1248    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  100 
 
 		 1681 aa  3462    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  42.77 
 
 		 1558 aa  844    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  42.32 
 
 		 1599 aa  1132    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  79.14 
 
 		 335 aa  308  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  30.96 
 
 		 1464 aa  246  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1600 aa  241  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.72 
 
 		 2096 aa  226  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1352 aa  212  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.44 
 
 		 2149 aa  194  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.24 
 
 		 1271 aa  193  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.72 
 
 		 1467 aa  191  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1531 aa  181  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  23.33 
 
 		 1568 aa  172  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 927 aa  162  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  23.1 
 
 		 1530 aa  161  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1400 aa  160  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.17 
 
 		 2035 aa  160  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1602 aa  159  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.25 
 
 		 2277 aa  154  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.03 
 
 		 924 aa  154  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.37 
 
 		 1485 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24 
 
 		 1541 aa  154  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.57 
 
 		 1576 aa  153  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  24 
 
 		 1541 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1553 aa  154  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.39 
 
 		 1362 aa  153  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.97 
 
 		 3027 aa  153  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24 
 
 		 1541 aa  154  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  24 
 
 		 1541 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  24 
 
 		 1541 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  23.72 
 
 		 1381 aa  153  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24 
 
 		 1541 aa  151  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.12 
 
 		 1614 aa  150  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.13 
 
 		 1942 aa  148  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1550 aa  147  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1547 aa  146  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1917 aa  146  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.46 
 
 		 1527 aa  145  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  25.37 
 
 		 1485 aa  142  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  26.05 
 
 		 1577 aa  139  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.78 
 
 		 1348 aa  139  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24.13 
 
 		 1520 aa  138  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  23.5 
 
 		 903 aa  138  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.62 
 
 		 1572 aa  138  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  22.68 
 
 		 1381 aa  137  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.93 
 
 		 1259 aa  137  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1611 aa  135  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.28 
 
 		 1595 aa  135  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.37 
 
 		 1669 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.59 
 
 		 1586 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.49 
 
 		 3193 aa  134  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.54 
 
 		 1508 aa  131  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.49 
 
 		 1840 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.97 
 
 		 1488 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1527 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  24.3 
 
 		 1428 aa  129  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1419 aa  128  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  24.74 
 
 		 1528 aa  125  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25.27 
 
 		 1008 aa  125  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.27 
 
 		 1008 aa  125  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.92 
 
 		 2225 aa  125  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.41 
 
 		 1466 aa  125  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.08 
 
 		 2731 aa  124  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  24.45 
 
 		 1699 aa  123  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.59 
 
 		 690 aa  122  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1620 aa  122  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.12 
 
 		 1345 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.12 
 
 		 1345 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1834 aa  119  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1189 aa  119  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  30.54 
 
 		 1411 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26.41 
 
 		 2221 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  30.15 
 
 		 451 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  22.9 
 
 		 889 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  22.63 
 
 		 1475 aa  116  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1492 aa  116  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  29.87 
 
 		 866 aa  115  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1583 aa  116  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  29.93 
 
 		 480 aa  115  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.51 
 
 		 1626 aa  115  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  23.22 
 
 		 931 aa  115  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  26.25 
 
 		 765 aa  115  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.86 
 
 		 1560 aa  115  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  22.87 
 
 		 1556 aa  115  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1386 aa  115  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  34.9 
 
 		 678 aa  115  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  27.88 
 
 		 3689 aa  113  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.76 
 
 		 2246 aa  114  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  29.87 
 
 		 561 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  25.27 
 
 		 2178 aa  113  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1565 aa  113  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1565 aa  113  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  24.85 
 
 		 913 aa  113  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1409 aa  112  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.74 
 
 		 1528 aa  112  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  25.37 
 
 		 1494 aa  112  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1494 aa  112  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  25.92 
 
 		 1147 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>