More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0188 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  65.86 
 
 		 1160 aa  1368    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1147 aa  2332    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  32.97 
 
 		 1345 aa  310  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  32.97 
 
 		 1345 aa  310  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  33.44 
 
 		 1008 aa  302  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  33.44 
 
 		 1008 aa  302  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1352 aa  275  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28.08 
 
 		 1600 aa  239  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.99 
 
 		 1271 aa  213  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.14 
 
 		 2096 aa  210  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  27.94 
 
 		 2294 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1551 aa  186  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.88 
 
 		 1527 aa  184  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.37 
 
 		 1560 aa  174  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1959 aa  166  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.12 
 
 		 2277 aa  165  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.64 
 
 		 2149 aa  164  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.41 
 
 		 1599 aa  164  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 2035 aa  163  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.85 
 
 		 2731 aa  162  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  27.39 
 
 		 1381 aa  161  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.64 
 
 		 1518 aa  160  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1520 aa  160  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.75 
 
 		 3027 aa  157  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1547 aa  156  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  26.59 
 
 		 1495 aa  154  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.93 
 
 		 1576 aa  154  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.98 
 
 		 1528 aa  154  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.62 
 
 		 1467 aa  153  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.36 
 
 		 2003 aa  152  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1550 aa  151  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.15 
 
 		 1528 aa  149  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.63 
 
 		 1488 aa  147  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.6 
 
 		 1953 aa  145  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1942 aa  145  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.34 
 
 		 1464 aa  142  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  26.07 
 
 		 1732 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.35 
 
 		 1840 aa  141  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1917 aa  141  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1418 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1390 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1554 aa  140  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.8 
 
 		 927 aa  140  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1669 aa  139  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1611 aa  139  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25 
 
 		 1362 aa  138  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  26.89 
 
 		 913 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1531 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  24.2 
 
 		 1402 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.11 
 
 		 1509 aa  135  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.02 
 
 		 1259 aa  135  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.22 
 
 		 1595 aa  134  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  24.61 
 
 		 1539 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1623 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  23.58 
 
 		 1434 aa  133  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.91 
 
 		 1572 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.82 
 
 		 1429 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03366  Rhs family protein  32.78 
 
 		 337 aa  131  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000332584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 3193 aa  131  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  23.87 
 
 		 1508 aa  131  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1558 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.12 
 
 		 1348 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1197 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1390 aa  129  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  28.12 
 
 		 678 aa  128  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.2 
 
 		 1586 aa  128  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1419 aa  128  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  25.89 
 
 		 2658 aa  126  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.36 
 
 		 903 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.04 
 
 		 1614 aa  126  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.75 
 
 		 1577 aa  125  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.61 
 
 		 2246 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.1 
 
 		 1609 aa  122  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.19 
 
 		 1386 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  24.53 
 
 		 869 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 3273 aa  121  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  26.83 
 
 		 934 aa  121  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  27.48 
 
 		 1586 aa  121  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  23.82 
 
 		 1379 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  26.58 
 
 		 2349 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.86 
 
 		 1626 aa  119  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.54 
 
 		 1400 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  23.94 
 
 		 1981 aa  118  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  25.33 
 
 		 765 aa  118  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  25.22 
 
 		 1710 aa  118  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1553 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.15 
 
 		 1568 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  28.43 
 
 		 3689 aa  116  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  25.14 
 
 		 1457 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1410 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25 
 
 		 924 aa  116  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  22.92 
 
 		 1485 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  24.98 
 
 		 1423 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  28.19 
 
 		 902 aa  115  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  24.7 
 
 		 2224 aa  115  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  24.84 
 
 		 1475 aa  114  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  25 
 
 		 2221 aa  115  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  23.99 
 
 		 1573 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  24.54 
 
 		 2224 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  24.54 
 
 		 2224 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>