More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00948 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  99.1 
 
 
1345 aa  1753    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  99.1 
 
 
1345 aa  1753    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  100 
 
 
1008 aa  2032    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  100 
 
 
1008 aa  2032    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  65.69 
 
 
800 aa  535  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03366  Rhs family protein  73.46 
 
 
337 aa  482  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000332584  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  33.44 
 
 
1147 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  32.39 
 
 
1160 aa  327  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28.91 
 
 
1600 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  29.13 
 
 
1352 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.72 
 
 
2096 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  27.48 
 
 
1271 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.51 
 
 
1599 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.17 
 
 
1467 aa  212  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  30.64 
 
 
2003 aa  204  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.4 
 
 
1464 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  29.54 
 
 
2294 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.33 
 
 
1595 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.33 
 
 
1586 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  24 
 
 
2035 aa  193  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.36 
 
 
1527 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.74 
 
 
1547 aa  190  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 
3193 aa  190  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.79 
 
 
2149 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.55 
 
 
1551 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.67 
 
 
1576 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.68 
 
 
2277 aa  183  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.98 
 
 
1611 aa  182  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  26.1 
 
 
2731 aa  180  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.79 
 
 
1560 aa  180  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 
1942 aa  179  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.67 
 
 
1614 aa  179  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.31 
 
 
1609 aa  177  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24.48 
 
 
1520 aa  177  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  26.32 
 
 
1495 aa  177  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.21 
 
 
1485 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.87 
 
 
1572 aa  175  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.64 
 
 
1917 aa  174  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.73 
 
 
1981 aa  173  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.68 
 
 
1669 aa  172  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.12 
 
 
1840 aa  171  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 
913 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.72 
 
 
3027 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.41 
 
 
1348 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.8 
 
 
1485 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.84 
 
 
1568 aa  166  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.2 
 
 
927 aa  166  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.16 
 
 
1959 aa  165  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  23.41 
 
 
1550 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  24.15 
 
 
1518 aa  165  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  29.93 
 
 
678 aa  164  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 
1197 aa  163  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.46 
 
 
1558 aa  163  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.79 
 
 
1362 aa  162  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.13 
 
 
1433 aa  162  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26.58 
 
 
2221 aa  161  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25 
 
 
1488 aa  161  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.49 
 
 
1528 aa  160  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  24.47 
 
 
1434 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.37 
 
 
1953 aa  160  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.95 
 
 
1384 aa  159  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.41 
 
 
1381 aa  158  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 
1531 aa  157  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.91 
 
 
924 aa  157  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27.27 
 
 
2246 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  26.7 
 
 
765 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 
3073 aa  154  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  25.16 
 
 
1530 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.05 
 
 
1259 aa  154  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  24.58 
 
 
1489 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  28.78 
 
 
690 aa  153  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.9 
 
 
1528 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.15 
 
 
2225 aa  152  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.1 
 
 
1494 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.1 
 
 
1494 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  27.1 
 
 
2178 aa  152  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  25.15 
 
 
1487 aa  151  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.3 
 
 
1419 aa  149  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  26.82 
 
 
869 aa  148  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  24.4 
 
 
1517 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  26.14 
 
 
2224 aa  148  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 
1554 aa  146  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  25 
 
 
1673 aa  145  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.73 
 
 
1508 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  24.34 
 
 
1732 aa  145  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.63 
 
 
903 aa  145  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.54 
 
 
1418 aa  145  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.86 
 
 
2224 aa  144  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.86 
 
 
2224 aa  144  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  25.47 
 
 
1421 aa  144  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25.34 
 
 
1679 aa  144  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 
1410 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 
1390 aa  143  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.01 
 
 
1411 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.25 
 
 
1509 aa  142  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.29 
 
 
1385 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.4 
 
 
1402 aa  142  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  26.35 
 
 
2349 aa  142  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  26.83 
 
 
1090 aa  141  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.31 
 
 
1834 aa  140  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>