More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0132 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  67.87 
 
 		 2658 aa  2345    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  91.01 
 
 		 765 aa  1243    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  47.35 
 
 		 1732 aa  1157    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  100 
 
 		 2349 aa  4798    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0152  YD repeat protein  76.55 
 
 		 307 aa  477  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  27.05 
 
 		 2178 aa  311  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  27.46 
 
 		 2221 aa  310  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  26.94 
 
 		 2224 aa  301  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  26.94 
 
 		 2224 aa  301  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  26.93 
 
 		 2224 aa  300  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  26.36 
 
 		 2246 aa  290  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  56.93 
 
 		 396 aa  281  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.93 
 
 		 2225 aa  217  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  30.45 
 
 		 1271 aa  206  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1352 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  29.52 
 
 		 2096 aa  177  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  27.93 
 
 		 765 aa  169  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1840 aa  161  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.57 
 
 		 1917 aa  158  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  26 
 
 		 1959 aa  156  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  29.68 
 
 		 678 aa  156  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1942 aa  151  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  27.1 
 
 		 2294 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  29.11 
 
 		 2486 aa  150  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1600 aa  147  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.59 
 
 		 3193 aa  146  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.12 
 
 		 1467 aa  146  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  29.03 
 
 		 1427 aa  145  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.59 
 
 		 1381 aa  141  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1669 aa  141  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.98 
 
 		 1464 aa  139  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 3073 aa  135  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.01 
 
 		 1599 aa  129  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 927 aa  128  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  32.44 
 
 		 400 aa  126  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.28 
 
 		 3027 aa  126  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.92 
 
 		 1576 aa  125  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  36.14 
 
 		 504 aa  125  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 2035 aa  121  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1834 aa  120  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  27.36 
 
 		 738 aa  119  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1147 aa  119  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1132  wall-associated protein  36.64 
 
 		 382 aa  119  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0407345  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  26.04 
 
 		 2731 aa  118  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  26.35 
 
 		 1008 aa  118  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.2 
 
 		 1595 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  24.85 
 
 		 2003 aa  118  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  26.35 
 
 		 1008 aa  118  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.42 
 
 		 2277 aa  117  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.2 
 
 		 1586 aa  118  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  27.27 
 
 		 1485 aa  117  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.65 
 
 		 788 aa  115  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.65 
 
 		 788 aa  115  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  27.04 
 
 		 690 aa  115  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.61 
 
 		 1384 aa  114  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1527 aa  113  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.28 
 
 		 2149 aa  112  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  26.06 
 
 		 1345 aa  112  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  26.06 
 
 		 1345 aa  112  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  23.84 
 
 		 1485 aa  112  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1551 aa  112  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1623 aa  111  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.61 
 
 		 1572 aa  112  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  25.43 
 
 		 1495 aa  112  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.58 
 
 		 903 aa  111  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  27.22 
 
 		 869 aa  111  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1433 aa  111  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.51 
 
 		 1362 aa  110  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 3273 aa  107  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  23.39 
 
 		 2350 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  24.56 
 
 		 2138 aa  107  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.07 
 
 		 1560 aa  106  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.28 
 
 		 1348 aa  105  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1611 aa  105  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  22.19 
 
 		 1609 aa  104  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.16 
 
 		 1577 aa  104  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.86 
 
 		 741 aa  103  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  28.39 
 
 		 1160 aa  104  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  26.79 
 
 		 889 aa  103  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  27.34 
 
 		 1517 aa  103  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  23.95 
 
 		 1568 aa  102  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1386 aa  102  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.57 
 
 		 1614 aa  102  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.17 
 
 		 1489 aa  102  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.27 
 
 		 1379 aa  102  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  25.84 
 
 		 1046 aa  102  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  22.13 
 
 		 1573 aa  102  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  32.9 
 
 		 2942 aa  101  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  24.81 
 
 		 6109 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1550 aa  101  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  27.5 
 
 		 1976 aa  100  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.63 
 
 		 1419 aa  99.8  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  21.84 
 
 		 1488 aa  99.8  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  25.47 
 
 		 705 aa  99.4  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  27.56 
 
 		 1763 aa  99  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.3 
 
 		 924 aa  98.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.95 
 
 		 1520 aa  99  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  23 
 
 		 1639 aa  98.6  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.02 
 
 		 1385 aa  97.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1531 aa  98.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>