More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2167 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2003 aa  4036    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  38.19 
 
 		 3193 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  28.46 
 
 		 2096 aa  290  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  29.5 
 
 		 1271 aa  276  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  30.58 
 
 		 1352 aa  271  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  30.15 
 
 		 2294 aa  269  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  30.07 
 
 		 1600 aa  234  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1942 aa  231  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1669 aa  228  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1917 aa  228  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1840 aa  216  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  28.2 
 
 		 1959 aa  214  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  27.19 
 
 		 2035 aa  214  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.05 
 
 		 3027 aa  213  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  44.06 
 
 		 963 aa  213  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.51 
 
 		 1362 aa  206  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3988  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  41.74 
 
 		 601 aa  206  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  30.71 
 
 		 1345 aa  201  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  30.71 
 
 		 1345 aa  201  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  28.01 
 
 		 1381 aa  200  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  30.78 
 
 		 1008 aa  198  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  30.78 
 
 		 1008 aa  198  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.19 
 
 		 1576 aa  197  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  27.05 
 
 		 1464 aa  197  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1611 aa  196  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.68 
 
 		 2277 aa  192  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  29.05 
 
 		 1595 aa  189  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  29.05 
 
 		 1586 aa  189  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.03 
 
 		 1614 aa  189  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  27.68 
 
 		 927 aa  188  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  29.81 
 
 		 2731 aa  188  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1996  hypothetical protein  41.33 
 
 		 900 aa  187  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17629  normal  0.339226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.62 
 
 		 1568 aa  186  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  28.75 
 
 		 1517 aa  186  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 3073 aa  184  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  28.2 
 
 		 1348 aa  184  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.66 
 
 		 1572 aa  184  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.33 
 
 		 2149 aa  176  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  26.89 
 
 		 924 aa  175  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.28 
 
 		 1362 aa  174  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.35 
 
 		 1485 aa  175  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1527 aa  173  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1197 aa  170  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  41.61 
 
 		 1991 aa  170  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  27.29 
 
 		 869 aa  168  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.84 
 
 		 1599 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.83 
 
 		 1466 aa  167  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  28.41 
 
 		 1488 aa  166  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1551 aa  166  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  26.92 
 
 		 1732 aa  165  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.94 
 
 		 1384 aa  163  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4532  hypothetical protein  40.43 
 
 		 774 aa  163  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.29 
 
 		 1560 aa  162  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  28.23 
 
 		 840 aa  162  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  28.52 
 
 		 1953 aa  162  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  26.33 
 
 		 1541 aa  160  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1386 aa  160  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  28.99 
 
 		 917 aa  160  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1547 aa  160  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1411 aa  159  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1541 aa  159  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1541 aa  159  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1541 aa  159  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  28.18 
 
 		 1528 aa  159  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1147 aa  158  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1541 aa  158  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  25.14 
 
 		 1530 aa  158  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  27.15 
 
 		 1609 aa  157  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  27.18 
 
 		 1981 aa  158  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  28.19 
 
 		 1489 aa  157  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1541 aa  157  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  27.2 
 
 		 1528 aa  157  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1381 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1410 aa  156  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.8 
 
 		 1531 aa  156  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  27.45 
 
 		 678 aa  156  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  29.43 
 
 		 690 aa  155  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1390 aa  155  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3488  YD repeat-containing protein  28.42 
 
 		 1023 aa  155  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0275829 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  27.81 
 
 		 1160 aa  154  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1553 aa  154  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  27.86 
 
 		 1577 aa  154  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1433 aa  154  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1492 aa  153  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  29.84 
 
 		 1259 aa  153  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.51 
 
 		 1434 aa  153  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1602 aa  153  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.39 
 
 		 1467 aa  152  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  30.26 
 
 		 2374 aa  152  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  27.42 
 
 		 1509 aa  152  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1409 aa  151  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.42 
 
 		 1494 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1494 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  24.46 
 
 		 1593 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1487 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1550 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  25.09 
 
 		 1485 aa  150  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1520 aa  150  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  28.04 
 
 		 738 aa  149  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  25.72 
 
 		 1410 aa  149  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>