More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0017 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  100 
 
 		 738 aa  1508    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  35.08 
 
 		 927 aa  301  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  34.52 
 
 		 1467 aa  263  6.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  32.9 
 
 		 903 aa  261  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  33.39 
 
 		 1381 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  35.49 
 
 		 690 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  31.78 
 
 		 913 aa  240  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  31.19 
 
 		 917 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  31.8 
 
 		 788 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  31.8 
 
 		 788 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  32.34 
 
 		 741 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  30.58 
 
 		 920 aa  230  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  31.27 
 
 		 889 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  30.63 
 
 		 764 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  30.09 
 
 		 1577 aa  219  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1198 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  29.97 
 
 		 1433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  30.24 
 
 		 705 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1390 aa  180  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  29.3 
 
 		 1576 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.48 
 
 		 1611 aa  178  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  27.97 
 
 		 1840 aa  177  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.68 
 
 		 1586 aa  174  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.68 
 
 		 1595 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.95 
 
 		 1429 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.93 
 
 		 1917 aa  171  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.23 
 
 		 1981 aa  168  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00576  RhsD protein  30.33 
 
 		 613 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1942 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1520 aa  164  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.67 
 
 		 1614 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.98 
 
 		 1560 aa  163  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.96 
 
 		 1550 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.74 
 
 		 1572 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1527 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  28.91 
 
 		 605 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1352 aa  157  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.96 
 
 		 2096 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1551 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1547 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1669 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  27.19 
 
 		 924 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.88 
 
 		 1384 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.31 
 
 		 1379 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.55 
 
 		 1609 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1600 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.4 
 
 		 1362 aa  147  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.92 
 
 		 1385 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1531 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.55 
 
 		 1568 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 866 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1959 aa  145  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1400 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  31.03 
 
 		 468 aa  144  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1177 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1301 aa  142  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1409 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.66 
 
 		 1348 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1411 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.29 
 
 		 1271 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  25.63 
 
 		 1517 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.82 
 
 		 1488 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.31 
 
 		 3027 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1402 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  25.84 
 
 		 1421 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1386 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1197 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.79 
 
 		 1446 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1418 aa  136  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.99 
 
 		 1508 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  24.82 
 
 		 867 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1390 aa  134  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  24.66 
 
 		 1530 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.59 
 
 		 1953 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1319 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.31 
 
 		 1528 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.86 
 
 		 1599 aa  132  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 2003 aa  131  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  25.8 
 
 		 1359 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1834 aa  130  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  27.45 
 
 		 2350 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  24.51 
 
 		 1495 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  28.54 
 
 		 628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1527 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  24.44 
 
 		 1639 aa  129  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1602 aa  128  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 2035 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  24.11 
 
 		 1259 aa  127  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  25.36 
 
 		 1427 aa  127  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  25.46 
 
 		 1485 aa  126  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  23.41 
 
 		 1434 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  24.45 
 
 		 1673 aa  125  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  24.08 
 
 		 1528 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 1419 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  28.54 
 
 		 423 aa  124  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1554 aa  124  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1494 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25 
 
 		 1518 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>