More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04723 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  53.71 
 
 		 1577 aa  821    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  100 
 
 		 920 aa  1877    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00576  RhsD protein  83.47 
 
 		 613 aa  818    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  87.26 
 
 		 917 aa  1507    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  36.75 
 
 		 913 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  35.65 
 
 		 903 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00577  RhsD protein  75.59 
 
 		 683 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  36.92 
 
 		 889 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  34.54 
 
 		 1467 aa  364  3e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  33.16 
 
 		 1381 aa  351  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  32.19 
 
 		 927 aa  350  6e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  33.38 
 
 		 764 aa  301  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  35.69 
 
 		 788 aa  294  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  35.69 
 
 		 788 aa  294  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  35.66 
 
 		 705 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  30.04 
 
 		 1198 aa  283  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  33.92 
 
 		 741 aa  281  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  34.19 
 
 		 690 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  29.97 
 
 		 1433 aa  260  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1301 aa  252  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  30.05 
 
 		 738 aa  232  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  34.27 
 
 		 1177 aa  229  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  30.11 
 
 		 605 aa  187  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  34.3 
 
 		 468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  30.78 
 
 		 1271 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1352 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.77 
 
 		 2096 aa  168  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.49 
 
 		 3027 aa  164  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1390 aa  157  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1550 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00943  rhs-related protein  46.93 
 
 		 681 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 2035 aa  149  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2292  hypothetical protein  33.02 
 
 		 347 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  26.49 
 
 		 1427 aa  145  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1517 aa  145  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.89 
 
 		 1981 aa  144  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1600 aa  142  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.86 
 
 		 1576 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.51 
 
 		 1489 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.03 
 
 		 1611 aa  140  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1547 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.23 
 
 		 1572 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.61 
 
 		 1586 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1520 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.24 
 
 		 1595 aa  138  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1840 aa  138  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.3 
 
 		 2277 aa  137  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.51 
 
 		 1609 aa  137  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  26.57 
 
 		 1197 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.48 
 
 		 1614 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.61 
 
 		 1488 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1669 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1942 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00945  rhs-related protein  41.62 
 
 		 587 aa  134  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26 
 
 		 1528 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1917 aa  131  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.01 
 
 		 1485 aa  130  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  38.5 
 
 		 818 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1527 aa  130  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  43.45 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.78 
 
 		 1362 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1834 aa  128  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1189 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  25.03 
 
 		 1554 aa  127  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.8 
 
 		 2149 aa  125  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.76 
 
 		 1518 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1586 aa  124  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 3073 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.27 
 
 		 2003 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.28 
 
 		 1259 aa  122  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1959 aa  121  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00908  putative RSH-related protein  43.14 
 
 		 319 aa  121  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303359 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1541 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1541 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1381 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1541 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  24.14 
 
 		 1434 aa  118  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.02 
 
 		 1560 aa  118  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  22.94 
 
 		 1673 aa  118  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.4 
 
 		 1509 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.1 
 
 		 1429 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4267  YD repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1562 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4406  YD repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1562 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  23.73 
 
 		 1338 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.03 
 
 		 1599 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.46 
 
 		 1384 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  23.79 
 
 		 1418 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.02 
 
 		 1508 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1149 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.94 
 
 		 1568 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  23.38 
 
 		 1679 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1541 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  23.54 
 
 		 1402 aa  115  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  24.97 
 
 		 1379 aa  115  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  25.75 
 
 		 1495 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  27.62 
 
 		 1626 aa  115  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.25 
 
 		 1976 aa  114  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  23.54 
 
 		 1390 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1541 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>