215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00577 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00577  RhsD protein  100 
 
 		 683 aa  1388    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  40.61 
 
 		 1577 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  75.59 
 
 		 920 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  75.2 
 
 		 917 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  31.05 
 
 		 1381 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  35.5 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00945  rhs-related protein  33.92 
 
 		 587 aa  246  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  33.04 
 
 		 818 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
NC_003296  RS00943  rhs-related protein  30.73 
 
 		 681 aa  190  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  29.15 
 
 		 1467 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1177 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_003296  RS02144  putative RHS-related transmembrane protein  30.11 
 
 		 863 aa  164  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2470  rhs-related protein  29.06 
 
 		 890 aa  150  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1301 aa  147  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6263  YD repeat-containing protein  28.21 
 
 		 939 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00941  rhs-related protein  25.93 
 
 		 881 aa  144  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  34.25 
 
 		 903 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  34.25 
 
 		 889 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  35.71 
 
 		 913 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.19 
 
 		 2096 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1198 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2445  YD repeat-containing protein  29.39 
 
 		 526 aa  114  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2444  Rhs family protein-like protein  28.83 
 
 		 661 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.49 
 
 		 2277 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20510  hypothetical protein  29.23 
 
 		 324 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829879  normal  0.312494 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1433 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  31.14 
 
 		 927 aa  99.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32840  hypothetical protein  32.76 
 
 		 317 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00770451  hitchhiker  0.000240628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0016  YD repeat protein  30.04 
 
 		 1074 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15112  hitchhiker  0.0000418837 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6258  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 509 aa  94.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.3 
 
 		 3027 aa  88.2  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1352 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.32 
 
 		 2149 aa  85.1  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.65 
 
 		 2035 aa  83.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2320  YD repeat-containing protein  27.06 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0339952  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23 
 
 		 1917 aa  80.5  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32850  hypothetical protein  27.51 
 
 		 338 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.367921  hitchhiker  0.000249189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.3 
 
 		 1840 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  29.54 
 
 		 1271 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.16 
 
 		 1489 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1600 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  26.54 
 
 		 1368 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.51 
 
 		 1669 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  21.51 
 
 		 1942 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5044  YD repeat protein  29.26 
 
 		 820 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928216  normal  0.520262 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  32.47 
 
 		 1485 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2598  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 802 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000325868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1963  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 781 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0257216  decreased coverage  0.00891251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 3193 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  23.9 
 
 		 1953 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.71 
 
 		 1518 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.25 
 
 		 1611 aa  68.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.59 
 
 		 1959 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  25.82 
 
 		 6272 aa  68.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2321  YD repeat-containing protein  30.11 
 
 		 500 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0122033  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  32 
 
 		 1626 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  23.3 
 
 		 1565 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  23.3 
 
 		 1565 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  28.71 
 
 		 1543 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.84 
 
 		 1599 aa  62.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.71 
 
 		 1552 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  26.76 
 
 		 1609 aa  62.4  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.88 
 
 		 1428 aa  61.2  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.88 
 
 		 1579 aa  61.2  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1586 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  24.56 
 
 		 3689 aa  60.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1602 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  23.14 
 
 		 2144 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1699 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.55 
 
 		 1528 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 2374 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.51 
 
 		 1485 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  30.36 
 
 		 1417 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  30.36 
 
 		 1410 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  27.4 
 
 		 613 aa  57.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  26.18 
 
 		 2246 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  32.6 
 
 		 1620 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  26.18 
 
 		 2224 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  26.18 
 
 		 2225 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  29.76 
 
 		 1415 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27.5 
 
 		 2942 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  22.96 
 
 		 2003 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1381 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 		 2294 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  28.23 
 
 		 1259 aa  56.2  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  29.32 
 
 		 1593 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  30.22 
 
 		 1539 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  31.75 
 
 		 1604 aa  55.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  30.46 
 
 		 1710 aa  55.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1541 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.65 
 
 		 765 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  23.53 
 
 		 1428 aa  55.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  32.54 
 
 		 1583 aa  55.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1541 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1541 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25.88 
 
 		 1679 aa  54.7  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  25.13 
 
 		 2221 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  25.88 
 
 		 1673 aa  54.7  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.13 
 
 		 2224 aa  54.7  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  28.44 
 
 		 1418 aa  54.3  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>