49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32850  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  695    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.367921  hitchhiker  0.000249189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20510  hypothetical protein  54.94 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829879  normal  0.312494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32840  hypothetical protein  53.65 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00770451  hitchhiker  0.000240628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2321  YD repeat-containing protein  41.62 
 
 		 500 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0122033  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2320  YD repeat-containing protein  43.33 
 
 		 508 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0339952  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2444  Rhs family protein-like protein  32.06 
 
 		 661 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2445  YD repeat-containing protein  32.25 
 
 		 526 aa  162  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  32.14 
 
 		 1381 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6263  YD repeat-containing protein  32.06 
 
 		 939 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  33.99 
 
 		 1177 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_003296  RS02144  putative RHS-related transmembrane protein  36.57 
 
 		 863 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2470  rhs-related protein  34.76 
 
 		 890 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  29.75 
 
 		 818 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  35.16 
 
 		 499 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00945  rhs-related protein  32.95 
 
 		 587 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00943  rhs-related protein  30.86 
 
 		 681 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  31.53 
 
 		 1198 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  26.29 
 
 		 1467 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00577  RhsD protein  26.92 
 
 		 683 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5044  YD repeat protein  28.84 
 
 		 820 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928216  normal  0.520262 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6258  YD repeat-containing protein  25.94 
 
 		 509 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1963  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 781 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0257216  decreased coverage  0.00891251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  25.93 
 
 		 1892 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2598  YD repeat-containing protein  27.17 
 
 		 802 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000325868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  47.14 
 
 		 1577 aa  69.3  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1600 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0016  YD repeat protein  34.95 
 
 		 1074 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15112  hitchhiker  0.0000418837 
 
 
-
 
NC_003296  RS00941  rhs-related protein  27.13 
 
 		 881 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1301 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.46 
 
 		 2096 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.72 
 
 		 1953 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.53 
 
 		 1488 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.97 
 
 		 1626 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1433 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 934 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1352 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1527 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1551 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  27.09 
 
 		 2035 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  27.83 
 
 		 1485 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.87 
 
 		 2277 aa  46.2  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1669 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1520 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  27.92 
 
 		 1401 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.36 
 
 		 1271 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1942 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.31 
 
 		 3027 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1917 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  28.27 
 
 		 468 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>