95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_20510  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829879  normal  0.312494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32840  hypothetical protein  63.37 
 
 		 317 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00770451  hitchhiker  0.000240628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32850  hypothetical protein  54.94 
 
 		 338 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.367921  hitchhiker  0.000249189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2321  YD repeat-containing protein  43.16 
 
 		 500 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0122033  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2320  YD repeat-containing protein  45.48 
 
 		 508 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0339952  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  33.73 
 
 		 1381 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2445  YD repeat-containing protein  32.04 
 
 		 526 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2444  Rhs family protein-like protein  32.26 
 
 		 661 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02144  putative RHS-related transmembrane protein  34.28 
 
 		 863 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  36.68 
 
 		 499 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6263  YD repeat-containing protein  31.9 
 
 		 939 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2470  rhs-related protein  33.54 
 
 		 890 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  33.02 
 
 		 818 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
NC_003296  RS00945  rhs-related protein  34.6 
 
 		 587 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  39.46 
 
 		 1177 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  34.53 
 
 		 1198 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00577  RhsD protein  29.23 
 
 		 683 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00943  rhs-related protein  29.35 
 
 		 681 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5044  YD repeat protein  33.49 
 
 		 820 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928216  normal  0.520262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2598  YD repeat-containing protein  33.18 
 
 		 802 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000325868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1963  YD repeat-containing protein  34.91 
 
 		 781 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0257216  decreased coverage  0.00891251 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  26.42 
 
 		 1467 aa  80.1  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  27.48 
 
 		 1301 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6258  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1433 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  40.82 
 
 		 1577 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0016  YD repeat protein  32.35 
 
 		 1074 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15112  hitchhiker  0.0000418837 
 
 
-
 
NC_003296  RS00941  rhs-related protein  28.57 
 
 		 881 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  31.71 
 
 		 1892 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.74 
 
 		 1528 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  30.85 
 
 		 1271 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  27.02 
 
 		 1489 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1959 aa  56.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  27.76 
 
 		 1485 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  29.06 
 
 		 1259 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1197 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1147 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1352 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.52 
 
 		 889 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.52 
 
 		 903 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.29 
 
 		 3027 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  32.79 
 
 		 3273 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1600 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1917 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  27.44 
 
 		 1573 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  26.28 
 
 		 1415 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  27.07 
 
 		 1626 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.99 
 
 		 2277 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1669 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1505 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  26.57 
 
 		 1410 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  26.13 
 
 		 1616 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1942 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 2035 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25 
 
 		 1614 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.11 
 
 		 2096 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1600 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1840 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1268 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  28.57 
 
 		 1429 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  27.18 
 
 		 1368 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.14 
 
 		 1981 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  23.98 
 
 		 1401 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.26 
 
 		 3193 aa  45.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  23.39 
 
 		 1568 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1558 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1426 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1216 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  24.83 
 
 		 1200 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  24.83 
 
 		 1426 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  27.78 
 
 		 1710 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.02 
 
 		 1362 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  27.78 
 
 		 2497 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  23.47 
 
 		 1609 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  30.13 
 
 		 2374 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  28.57 
 
 		 1405 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  25.69 
 
 		 1397 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.89 
 
 		 1560 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  26.2 
 
 		 1528 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  25.69 
 
 		 1365 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  22.29 
 
 		 1541 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.17 
 
 		 2149 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  21.97 
 
 		 1381 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  21.97 
 
 		 1541 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  21.97 
 
 		 1541 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  21.97 
 
 		 1541 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  21.97 
 
 		 1541 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  21.97 
 
 		 1541 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1654 aa  42.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1466 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  23.85 
 
 		 1539 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  28.91 
 
 		 1411 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  25.52 
 
 		 1409 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  27.62 
 
 		 1426 aa  42.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1620 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>