More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5146 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2374 aa  4777    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  28.86 
 
 		 2486 aa  417  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.3 
 
 		 2096 aa  259  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.55 
 
 		 1959 aa  244  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.09 
 
 		 1840 aa  243  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.32 
 
 		 1271 aa  241  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.58 
 
 		 1917 aa  234  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.6 
 
 		 1942 aa  232  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1669 aa  211  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  28.95 
 
 		 3073 aa  191  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.51 
 
 		 1953 aa  170  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  26.11 
 
 		 2731 aa  170  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.16 
 
 		 2149 aa  159  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.96 
 
 		 2035 aa  159  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.54 
 
 		 3027 aa  158  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  25.06 
 
 		 3689 aa  157  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1352 aa  149  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  22.51 
 
 		 2277 aa  139  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.99 
 
 		 1600 aa  135  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1834 aa  132  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.55 
 
 		 3193 aa  129  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.45 
 
 		 1485 aa  128  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.25 
 
 		 1599 aa  125  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  29.33 
 
 		 2003 aa  123  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.98 
 
 		 2246 aa  122  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.78 
 
 		 1467 aa  120  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.78 
 
 		 2225 aa  119  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 3273 aa  118  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  25.31 
 
 		 1732 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.54 
 
 		 1381 aa  118  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.36 
 
 		 927 aa  115  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 2294 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26.47 
 
 		 2221 aa  112  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  27.37 
 
 		 705 aa  112  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  25.66 
 
 		 2349 aa  111  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.57 
 
 		 1464 aa  110  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  28.11 
 
 		 764 aa  110  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.25 
 
 		 1576 aa  110  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  25.95 
 
 		 2178 aa  108  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.57 
 
 		 1345 aa  108  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.57 
 
 		 1345 aa  108  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  26.04 
 
 		 765 aa  107  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.29 
 
 		 2224 aa  107  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.46 
 
 		 2224 aa  108  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.46 
 
 		 2224 aa  108  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  24.93 
 
 		 1681 aa  108  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  24.52 
 
 		 765 aa  107  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  26.62 
 
 		 738 aa  106  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  25.73 
 
 		 840 aa  105  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  26.9 
 
 		 678 aa  105  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.87 
 
 		 1379 aa  105  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.2 
 
 		 482 aa  105  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.61 
 
 		 1008 aa  104  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25.61 
 
 		 1008 aa  104  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  30.38 
 
 		 474 aa  104  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  24.79 
 
 		 2497 aa  104  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.33 
 
 		 788 aa  103  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.33 
 
 		 788 aa  103  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  27.22 
 
 		 741 aa  103  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.93 
 
 		 1509 aa  103  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.34 
 
 		 1572 aa  102  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1623 aa  101  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  25.4 
 
 		 1427 aa  100  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  23.49 
 
 		 869 aa  100  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.19 
 
 		 690 aa  99.8  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  26.08 
 
 		 2290 aa  99  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1558 aa  98.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.27 
 
 		 2017 aa  98.6  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  25.39 
 
 		 6272 aa  98.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1763 aa  99  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  26.71 
 
 		 1976 aa  97.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  26.54 
 
 		 1577 aa  98.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  31.67 
 
 		 396 aa  96.3  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  23.4 
 
 		 2658 aa  95.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.31 
 
 		 1614 aa  95.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1620 aa  94.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2324  YD repeat-containing protein  36.8 
 
 		 765 aa  94  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.2713  decreased coverage  0.00718158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  26.79 
 
 		 2145 aa  94  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 		 6109 aa  92.8  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1547 aa  92.4  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  22.28 
 
 		 2942 aa  92  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  22.33 
 
 		 1384 aa  92  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  22.78 
 
 		 1595 aa  91.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  26.29 
 
 		 2076 aa  91.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  23.52 
 
 		 1554 aa  91.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  22.72 
 
 		 1586 aa  90.9  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1520 aa  90.5  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1433 aa  90.1  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1611 aa  89.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.1 
 
 		 1528 aa  89.4  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.02 
 
 		 1485 aa  89.4  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  22.11 
 
 		 1527 aa  88.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.02 
 
 		 1551 aa  88.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  24.19 
 
 		 1673 aa  87.4  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  23.7 
 
 		 1487 aa  87.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  24.26 
 
 		 1434 aa  87.4  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  34.97 
 
 		 554 aa  87.4  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.36 
 
 		 1579 aa  87  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25 
 
 		 1488 aa  87  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.36 
 
 		 1428 aa  86.3  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>