59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32840 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32840  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00770451  hitchhiker  0.000240628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20510  hypothetical protein  63.37 
 
 		 324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829879  normal  0.312494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32850  hypothetical protein  53.65 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.367921  hitchhiker  0.000249189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2320  YD repeat-containing protein  46.98 
 
 		 508 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0339952  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2321  YD repeat-containing protein  44.44 
 
 		 500 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0122033  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_003296  RS02144  putative RHS-related transmembrane protein  38.39 
 
 		 863 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2444  Rhs family protein-like protein  33.33 
 
 		 661 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  38.83 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6263  YD repeat-containing protein  40.43 
 
 		 939 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2445  YD repeat-containing protein  32.37 
 
 		 526 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  34.19 
 
 		 1381 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  34.06 
 
 		 818 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  41.18 
 
 		 1177 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2470  rhs-related protein  35.79 
 
 		 890 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00945  rhs-related protein  35.53 
 
 		 587 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00943  rhs-related protein  31.32 
 
 		 681 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  32.89 
 
 		 1198 aa  99  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00577  RhsD protein  32.41 
 
 		 683 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2598  YD repeat-containing protein  32.2 
 
 		 802 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000325868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1963  YD repeat-containing protein  32.42 
 
 		 781 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0257216  decreased coverage  0.00891251 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  29.67 
 
 		 1467 aa  86.7  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6258  YD repeat-containing protein  36.99 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5044  YD repeat protein  27.05 
 
 		 820 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928216  normal  0.520262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1301 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  31.11 
 
 		 1577 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00941  rhs-related protein  23.5 
 
 		 881 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0016  YD repeat protein  33.33 
 
 		 1074 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15112  hitchhiker  0.0000418837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1433 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  27.62 
 
 		 1489 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  30.68 
 
 		 1415 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1352 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1600 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.94 
 
 		 1626 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  28.91 
 
 		 1892 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  27.7 
 
 		 1259 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.71 
 
 		 1953 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.1 
 
 		 1485 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  34.43 
 
 		 3273 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.19 
 
 		 2277 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.64 
 
 		 1271 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1620 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1410 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  28.42 
 
 		 1388 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  22.68 
 
 		 1528 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.33 
 
 		 2035 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  39.47 
 
 		 2497 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  22.75 
 
 		 2149 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  27.24 
 
 		 1410 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  38.71 
 
 		 1528 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  31.25 
 
 		 3689 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1197 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  23.31 
 
 		 1495 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.51 
 
 		 1362 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25 
 
 		 2096 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  41.33 
 
 		 422 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  22.54 
 
 		 1359 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1669 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1492 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.09 
 
 		 1348 aa  42.4  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>