88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2320 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2320  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 508 aa  1048    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0339952  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2321  YD repeat-containing protein  56.4 
 
 		 500 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0122033  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20510  hypothetical protein  45.48 
 
 		 324 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829879  normal  0.312494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32840  hypothetical protein  46.98 
 
 		 317 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00770451  hitchhiker  0.000240628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32850  hypothetical protein  43.33 
 
 		 338 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.367921  hitchhiker  0.000249189 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  33.6 
 
 		 1381 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2444  Rhs family protein-like protein  32.17 
 
 		 661 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2445  YD repeat-containing protein  32.74 
 
 		 526 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6263  YD repeat-containing protein  29.53 
 
 		 939 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02144  putative RHS-related transmembrane protein  29.61 
 
 		 863 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  33.33 
 
 		 818 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  34.77 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1177 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2470  rhs-related protein  29.44 
 
 		 890 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00945  rhs-related protein  32.32 
 
 		 587 aa  127  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6258  YD repeat-containing protein  28.61 
 
 		 509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  31.5 
 
 		 1577 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5044  YD repeat protein  28.54 
 
 		 820 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928216  normal  0.520262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  25.97 
 
 		 1892 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  32.97 
 
 		 1198 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.94 
 
 		 1467 aa  93.6  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00943  rhs-related protein  27.8 
 
 		 681 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0016  YD repeat protein  24.77 
 
 		 1074 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15112  hitchhiker  0.0000418837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2598  YD repeat-containing protein  26.63 
 
 		 802 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000325868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00577  RhsD protein  26.55 
 
 		 683 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1963  YD repeat-containing protein  26.82 
 
 		 781 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0257216  decreased coverage  0.00891251 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 2035 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1959 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  23.64 
 
 		 1359 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.15 
 
 		 2096 aa  61.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1352 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  26.36 
 
 		 2225 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  26.36 
 
 		 2178 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1368 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  26.09 
 
 		 2224 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  26.09 
 
 		 2224 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00941  rhs-related protein  22.63 
 
 		 881 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.82 
 
 		 2224 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  30.18 
 
 		 1614 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26.09 
 
 		 2221 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1620 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  24.76 
 
 		 1421 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  27.13 
 
 		 903 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1301 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  22.61 
 
 		 1485 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.22 
 
 		 2277 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.54 
 
 		 2246 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  22.92 
 
 		 1259 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  26.72 
 
 		 889 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  22.3 
 
 		 1446 aa  50.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1531 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 2003 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  21.87 
 
 		 1576 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 3193 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.25 
 
 		 1840 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  27.41 
 
 		 3689 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  35.61 
 
 		 1710 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  23.04 
 
 		 1495 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  29.05 
 
 		 1197 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  25.58 
 
 		 6272 aa  47.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  22.31 
 
 		 1437 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  21.68 
 
 		 1917 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  28.63 
 
 		 1409 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.63 
 
 		 1489 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  23.11 
 
 		 1401 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  34.81 
 
 		 1368 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1410 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1669 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.38 
 
 		 1362 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  29.66 
 
 		 1639 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  35.11 
 
 		 1602 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  35.82 
 
 		 1609 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  28.88 
 
 		 1579 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1553 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  28.81 
 
 		 690 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  28.81 
 
 		 927 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  28.88 
 
 		 1428 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.85 
 
 		 1429 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  20.91 
 
 		 1433 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1654 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1679 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.46 
 
 		 3027 aa  44.3  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1600 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.7 
 
 		 1599 aa  43.9  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  28.4 
 
 		 1572 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  31.68 
 
 		 1485 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.85 
 
 		 1271 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  20.75 
 
 		 1942 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>